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Actes des préfectures · Haute-Savoie

RAA_etat74_20260828_391

Recueil des actes administratifs publié le 28 août 2026 · partie 2 sur 3, pages 55 à 122

1acte
246pages

Les actes de cette partie

Les actes qui commencent entre les pages 55 et 122. Sommaire complet du recueil

Aucun acte du sommaire ne commence dans cette partie : elle poursuit un acte commencé plus tôt.

Texte intégral · partie 2 sur 3

Pages 55 à 122 sur 246 du texte extrait du PDF publié par la préfecture. Seul le PDF officiel fait foi.

Tous les ouvrages installés sur les cours d’eau sont transparents pour la continuité écologique, ils ne constituent pas d’obstacles pour les espèces piscicoles et le transport sédimentaire (MR60). Chaque ouvrage de franchissement d’un cours d’eau comprend a minima un matelas alluvial reconstitué, un lit d’étiage et une banquette permettant le transit des espèces terrestres (MR60). La reconstitution d’un lit mineur emboîté au sein d’un lit majeur de forme trapézoïdale comprenant des berges en pente douce est mis en œuvre avec un lit d’étiage dimensionné pour le QMNA5 lorsque le débit du cours d’eau est suffisant afin de garantir un tirant d’eau de 10 cm. Pour les cours d’eau à faible débit ou intermittents le lit d’étiage prend la forme d’un V afin d’optimiser un niveau d’eau suffisant. Au sein de l’ouvrage, le substrat reconstitué comprend : - une sous-couche en matériaux granulaires compactés D65 insensibles à l’eau de 40 cm minimum ; - une couche supérieure de substrat de 10 cm d’épaisseur minimum. Les banquettes faune selon les ouvrages peuvent prendre les caractéristiques suivantes selon le contexte spécifique de chaque ouvrage (forces érosives, débit,…) : - une surlargeur en rive de 3 m de large calée à Q2 en matériaux granulaires compactés insensibles à l’eau - une banquette surplombant le lit mineur de 50 cm de large calées à Q10, composée en matériaux granulaires compactés insensibles à l’eau ou en enrochement noyés dans le béton (cas des berges avec fruit supérieur à 3H/2V) ; - des banquettes faune de 50 cm de large calée à Q10 en béton plein ou en console. Les différents types d’aménagements au sein d’ouvrages cadres sont décrites en annexe 8. Chaque ouvrage est complété y compris en aval et en amont par des enrochements libres dont la blocométrie et l’agencement sont adaptés à la profondeur d’affouillement et à la vitesse de charriage spécifiques pour chaque site. Dans le cas d’une profondeur totale d’affouillement supérieure à 50 cm pour une crue décennale, des enrochements sont mis en œuvre : - en fond de lit implanté au même niveau que le radier de l’ouvrage, - sur une largeur équivalente à l’ouverture de l’ouvrage, - sur une longueur équivalente à 2 fois l’ouverture hydraulique de l’ouvrage - sur une épaisseur d’environ 1 m Les enrochements remontent sur le talus de la berge jusqu’à la cote Q10 en cohérence avec le niveau de la banquette faune présente dans l’ouvrage. En cas de besoin pour le maintien du matelas alluvial reconstitué, des enrochements liaisonnés au sein de l’ouvrage sont réalisés. Le profil en long du lit du cours d’eau est équilibré entre l’amont, l’ouvrage de traversée et l’aval afin de garantir le transport sédimentaire et la circulation des espèces piscicoles. Les ouvrages de traversée, leurs annexes et les aménagements connexes y compris la végétalisation des berges facilitent le passage des espèces aquatiques et terrestres entre l’amont et l’aval. ARTICLE 24.5 Dérivation de cours d’eau Dérivation temporaire L’installation d’ouvrages dans le cours d’eau est réalisée en assec naturel ou en détournant les eaux provisoirement. 52 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 55
La dérivation des eaux peut être réalisée à l’avancement des travaux par batardeaux constitués de matériaux du site en laissant au maximum le cours d’eau au sein de son lit. La mise en assec artificiel du lit du cours d’eau peut être réalisée par pompage ou par dérivation gravitaire. Le linéaire du tronçon asséché est limité au strict nécessaire permettant la réalisation de l’ouvrage (franchissement temporaire ou définitif, enrochement, dérivation définitive). Toute dérivation fait l’objet des mesures préalables suivantes : - repérage des enjeux spécifiques par un écologue pour chaque site, - réalisation de pêche électrique en cas de cours d’eau piscicoles, - décantation et filtration avant rejet dans le cours d’eau naturel. Les créations de dérivation gravitaire temporaire sont réalisées en assec de l’aval vers l’amont. Leur gabarit hydraulique est équivalent à celle du cours d’eau court-circuité. À l’amont, les terrassements s’arrêtent quelques mètres avant les berges existantes. La mise en eau de la dérivation gravitaire s’opère progressivement afin de limiter les départs de fines. Tout autre moyen est mis en œuvre pour éviter tout rejet turbide dans le cours d’eau naturel à l’aval (géotextile, décantation, filtration). La remise en eau définitive est réalisée de manière progressive et accompagnée par des moyens de filtration adaptés. Dérivation définitive – cours d’eau rescindés Les cours d’eau faisant l’objet de modifications définitives de leur tracé sont listés en annexe 9. Le matelas alluvial est reconstitué avec les matériaux provenant de l’ancien cours d’eau et complété avec des matériaux d’apport alluviaux en cas de déficit. L’épaisseur du matelas alluvial ne peut être inférieur à 50 cm. La recharge du lit du cours d’eau est réalisée à l’aide de matériaux de granulométrie équivalente à celle existante, favorable à la faune piscicole. L’ajout d’éléments plus grossiers est intégré afin de garantir le maintien du profil dans le temps et éviter la perte des éléments plus fins. Des micros seuils et des rides de blocs ancrées dans la berge (1 m minimum) sont mis en place afin de garantir la stabilité du profil en long. La hauteur de chute ne dépasse pas 15 cm. Dans les faciès d’écoulements propices à la reproduction de la Truite fario ou du Chabot commun, la granulométrie sur les 25 cm en surface est déterminée par les exigences de ces deux espèces. Une surface de 85 m² de frayères à truite fario et de 204 m² de frayères à chabot est reconstituée au droit des cours d’eau impactés, en remplacement des frayères potentielles détruites lors des travaux (MR7.f). Le dimensionnement du lit du cours d’eau est réalisé sur le principe des lits emboîtés. Le lit d’étiage est calé sur le débit QMNA5 et prend une forme trapézoïdale pour les cours d’eau au débit d’étiage suffisant pour assurer 10 cm d’eau. Pour les cours d’eau intermittent ou à faible débit d’étiage, le lit d’étiage prend une forme en V. 53 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 56
Le lit mineur est calé sur le débit Qmodule, le lit plein bord calé sur le débit de crue journalier biennal Q J2 (pente de 0/1). Le lit majeur est calé sur un niveau de crue décennale ; les berges ont un fruit de 2/1, les berges en extrados ont un fruit de 3/2. La sinuosité du rescindement est établi en cohérence avec le coefficient de sinuosité du cours d’eau à l’origine. Le profil en long du cours d’eau rescindé respecte les caractéristiques des faciès du cours d’eau à l’origine (radier, plat lotique, plat lentique, fosse). La diversité des habitats est recherchée. La mise en eau s’opère suivant les mêmes précautions que celles décrites dans la partie « dérivation temporaire » du présent article. ARTICLE 24.6 Rescindements, dérivations et restauration des écoulements Les opérations de rescindement ou de déplacement de cours d’eau donnent lieu à un dossier d’exécution présentant les caractéristiques des lits provisoires d’écoulement, des lits définitifs avec l’ensemble des aménagements prévus ainsi qu’un phasage des travaux. Il est transmis au service de la police de l’eau pour information avant le démarrage des travaux sur les cours d’eau concernés. Ces projets d’exécutions doivent intégrer et répondre aux prescriptions des fiches zone humide et fiches cours d’eau du dossier de demande d'autorisation afin de garantir le maintien des fonctionnalités écologiques du cours d'eau et des zones humides associées (continuité hydraulique, maintien des niveaux d’eau, durées d’engorgement, débordements utiles, connexions latérales et conditions pédohydriques nécessaires aux habitats humides concernés). Les techniques de génie végétal et de diversification morphologique sont privilégiées dès lors qu’elles sont compatibles avec la sécurité de l’infrastructure et démontrent une meilleure résilience fonctionnelle. La mise en eau des lits provisoires et définitifs des cours d'eau dans le cas de dérivation et rescindements donnent lieu au préalable à une réception sur site à laquelle sont conviées le service de la police de l'eau afin de viser la bonne réalisation des mesures de restauration prévues. ARTICLE 24.7 Confortement des berges Les protections de berge sont mises en œuvre en amont et aval des ouvrages de traversée définitifs selon les prescriptions de l’article 24.5. En fonction des puissances spécifiques et des vitesses estimées dans les cours d’eau rescindés, des confortements de berge sont réalisés dans les extrados des nouveaux méandres : - en fascines végétalisées pour des puissances spécifiques modérées - en enrochements libres pour des puissances spécifiques importantes Ces deux types de protections de berge sont présentés en annexe 10. Le niveau d’enrochements libres ne dépasse pas la côte Q10 de la berge aménagée. La blocométrie et la profondeur d’ancrage sont adaptées à la profondeur d’affouillement et à la vitesse de charriage spécifique à chaque cours d’eau. L’agencement des blocs privilégie une rugosité importante pour éviter l’accélération des eaux et favoriser le maintien des matériaux alluvionnaires Les enrochements et les fascines sont complétés systématiquement en berge par la plantation d’arbustes typique des milieux rivulaires (Salix purpurea, Salix cinerea, Salix alba). 54 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 57
Les plantations rivulaires en accompagnement des protections de berge comprendront un arbuste tous les 2 mètres et 1 arbre de haut jet tous les 10 mètres. Un arbuste est planté tous les mètres et 1 arbre de haut jet tous les 10 mètres, 15 mètres en amont des ouvrages de traversée et 15 mètres en aval pour favoriser le passage de la faune piscicole et terrestre. Les espaces restés nus sont ensemencés. L’ensemble des plantations sont réalisées avec des espèces végétales adaptées au contexte local, précisées en annexe 11. ARTICLE 24.8 Remise en état Le bénéficiaire s’assure de la remise en état et de la réparation des ouvrages, accès ou terrains qui auraient été dégradés à l’occasion des travaux. Les aménagements nécessaires à la réalisation des travaux (piste d'accès, conditionnement des eaux par tuyaux, ouvrages de dérivation des eaux, buses et franchissements…) et mis en place provisoirement, sont retirés du lit du cours d'eau, lequel est remis en état et revégétalisé. À l’issue des travaux, les sites d’intervention, aires de stockage, bases de vie, accès et l’ensemble des emprises du chantier sont nettoyés, remis en état et revégétalisés. Si le lit et les berges du cours d’eau ou des zones sensibles délimitées sont dégradés pendant les travaux, ils sont restaurés à l’issue des travaux (plantations d’essences locales adaptées aux bords des cours d’eau, emploi de techniques végétales de protection…). Le bénéficiaire veille au bon entretien des ouvrages et installations mis en place. Ainsi, une visite régulière des aménagements (une visite annuelle au minimum et une visite après chaque événement pluvieux important) permet de surveiller leur comportement et de juger de la nécessité de leur entretien et de leur nettoyage afin d'assurer leur bon fonctionnement. ARTICLE 24.9 Suivis des cours d’eau touchés par les aménagements Les ouvrages hydrauliques, leurs annexes et les rescindements de cours d’eau font l’objet d’un suivi pendant la durée du chantier visant à vérifier : - la bonne réalisation des aménagements, - le respect des prescriptions de l’arrêté, - la réception des travaux en conformité avec les objectifs initiaux (positionnement des ouvrages, profil en long, reconstitution du matelas alluvial). Un suivi hydrologique pluriannuel est réalisé sur une durée minimum de 9 ans à intervalle régulier et après chaque évènement météorologique majeur. Il est vérifié la bonne atteinte des objectifs fonctionnels (connexion hydraulique suffisante, absence de colmatage, diversité des faciès d’écoulements, limitation des érosions et maintien des ouvrages). Les tronçons de cours d’eau aménagés font l’objet des suivis suivants : - un suivi hydromorphologique (protocole CARYHCE) à N+1, N+3, N+6 et N+9, - un suivi de la franchissabilité piscicole (protocole ICE) à N+1, N+3, N+6 et N+9, - un suivi des frayères (inventaire annuelle) à N+1, N+2, N+3, N+4, N+5, - un suivi du peuplement piscicole (indice IAT à N+2, N+4, N+6, indice IPR à N+1, N+2, N+3, - un suivi hydrobiologique (indice IBD, indice I2M2, indice IPR, indice IAM) à N+1, N+3 et N+5. 55 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 58
Aux endroits qui auront été enherbés ou végétalisés (plantations), un suivi de la reprise de la végétation est réalisé par le pétitionnaire pendant au moins 5 ans. Une attention particulière est portée sur la continuité de la végétation arbustive en bordure de tous les cours d’eau et sur l’absence de plantes exotiques envahissantes. Un compte-rendu regroupant l’ensemble des suivis et leurs conclusions est envoyé annuellement au service police de l’eau. En cas de nécessité, ce document fait état des mesures correctives nécessaires. Toute action d’inventaires nécessaires à assurer la pertinence des suivis est réalisée avant le démarrage des travaux. Les données recueillies lors de pêches de sauvegarde sont valorisées et intégrées dans les suivis. ARTICLE 25 Travaux et installations en lit majeur Toute modification liée à la création de l’autoroute et impactant une zone inondable par débordement de cours d’eau fait l’objet de compensation volumique à une hauteur minimum de 100 % (MC06). Les volumes pris en compte correspondent aux volumes soustraits à l’occupation de la crue centennale avant aménagement. L’intégralité des compensations s’exercent à proximité immédiate en considérant la non-aggravation des risques sur les biens et les personnes et en privilégiant l’épandage des crues avant et après les ouvrages hydrauliques de traversée. Ces compensations volumiques sont réalisées en amont et en aval des ouvrages de franchissement par augmentation du gabarit hydraulique des cours d’eau. Ces mesures sont complétées par des noues, des dépressions et la conservation d’annexes hydrauliques. La bonne exécution des compensations des champs d’expansion des crues est vérifiée tout au long du chantier. En fin de construction, un rapport écrit est envoyé au service police de l’eau comparant les objectifs de compensations volumiques initiaux et les volumes réellement réalisés. En cas de non atteinte des objectifs initiaux, des actions correctives sont attendues. Les compensations volumiques sont détaillées dans un tableau en annexe 12. ARTICLE 26 Gestion des eaux pluviales ARTICLE 26.1 Avant le démarrage du chantier Pour rappel, le code civil s’applique, notamment les articles 640 et 641 : le propriétaire supérieur ne peut rien faire qui aggrave la servitude du fonds inférieur. Tout dévoiement du réseau d’eaux pluviales existant doit faire l’objet d’un accord du gestionnaire d’eaux pluviales (Thonon agglomération, autres). ARTICLE 26.2 Phase chantier Principe de gestion provisoire des eaux pluviales La gestion provisoire des eaux pluviales consiste à mettre en place : • un réseau de collecte (fossés) des eaux de ruissellement dans le périmètre du chantier ; • des bassins de décantation visant à abattre la charge de matières en suspension (MES) avant rejet dans le milieu récepteur extérieur aux emprises du chantier ; 56 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 59
• des dispositifs visant à limiter l’érosion causée par les ruissellements sur les surfaces décapées (dispositifs de filtration et/ou ralentissement des eaux tels que des filtres à paille, filtres en cailloux…). Les fossés temporaires sont équipés de seuils anti-érosion semi-perméables et doivent en complément être équipés de fosses de décantation servant de pièges à sédiment et favorisant la dissipation d’énergie. Les rejets directs vers le milieu naturel sont interdits. Les bassins provisoires de gestion des eaux pluviales sont démantelés à la fin des travaux. Pour l’ensemble du chantier, hors zones sensibles, le dimensionnement minimum des bassins temporaires est calculé sur la base d’un évènement biennal avec un débit de fuite maximum de 6 L/s/ha. Ces bassins temporaires sont également équipés :  d’un système permettant leur isolement en cas de pollution accidentelle,  d’une surverse permettant d’évacuer les écoulements excédentaires (supérieurs à la période de retour retenue pour le dimensionnement du bassin). Une coupe type d’un bassin provisoire est présentée en annexe 13. Les bassins peuvent être compartimentés avec la mise en œuvre d’un merlon central ou de barrières semi-perméables afin d’allonger le parcours de l’eau, le temps de séjour, et de favoriser ainsi le dépôt des particules. Contrôle et surveillance des ouvrages de gestion des eaux pluviales temporaires Un suivi régulier du réseau provisoire est réalisé par les équipes travaux et le responsable environnement qui veillent au bon état de fonctionnement de l’ensemble de ses organes : • taux de remplissage par les fines des bassins ; • colmatage des filtres ; • stabilité des berges des bassins ou fosses ; • érosion des dispositifs, fossés, descentes d’eau. Les contrôles sont réguliers, a minima hebdomadaires. Ils sont systématiques à l’annonce d’épisodes pluvieux d’importance et après leur survenance afin d'opérer les entretiens nécessaires. En complément, un protocole de suivi de la qualité des eaux superficielles est mis en place par le bénéficiaire en phase de préparation de chantier. Ainsi, en phase travaux, le bénéficiaire de l’autorisation réalise ou fait réaliser : • Une vérification quotidienne, visuelle ou olfactive de l’absence d’irisation ou autre forme de pollution (turbidité, déchets, objets flottants, odeurs) ; puis en fonction des enjeux physico-chimiques des cours d’eau (voir annexe 14 ; MR56, 57, 58) : • Pour les cours d’eau à enjeux faibles à modérés : ◦ Un suivi hebdomadaire in situ de la température, de la conductivité, du pH, de l’oxygène et de la turbidité ; ◦ Une analyse trimestrielle pour les paramètres MES, hydrocarbures selon les mêmes dispositions que l’article 26.4 ; ◦ En cas dégradation entre la valeur amont et la valeur aval, une fiche d’écart proposant des mesures correctives est produite et adressée au service eau-environnement de la DDT.  Pour les cours d’eau à enjeux forts : ◦ Un suivi continu avec système d’alertes in situ de la température, de la conductivité, du pH, de l’oxygène et de la turbidité ; ◦ Une analyse mensuelle pour les paramètres MES, hydrocarbures selon les mêmes dispositions que l’article 26.4 ; 57 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 60
◦ En cas dégradation entre la valeur amont et la valeur aval, les travaux à l’origine de la source de pollution sont immédiatement arrêtés et une fiche d’écart proposant des mesures correctives est produite et adressée au service eau-environnement de la DDT. Suivi des ouvrages de gestion des eaux pluviales temporaires Le suivi des ouvrages provisoires est réalisé au moyen de fiches de visites réalisées par le chargé environnement du chantier (MR56) : • consignation des observations issues du contrôle des ouvrages provisoires ; • dysfonctionnements éventuels ; • mesures correctives à apporter ; • diffusion aux équipes travaux pour action. En cas de pollution accidentelle, le chantier est stoppé sur le secteur touché et un protocole d’intervention d’urgence est mis en œuvre consistant notamment à avoir une équipe sur site formée à ce type d’intervention, disposer des kits anti-pollution adaptés (absorbants, barrages flottants, bâches, rétention...), bloquer et isoler les pollutions, enlever les hydrocarbures flottants ou décaisser les sols pollués puis les évacuer vers la filière de traitement appropriée. Il en va de même pour le nettoyage des engins. Les boues de lavage sont dirigées dans un bassin équipé en sortie d’un déshuileur et d’une vanne de sécurité avant rejet (système provisoire). Le bénéficiaire est tenu de mettre en place des aires étanches dédiées au stockage et à la manipulation des produits dangereux ou polluants (hydrocarbures, huiles…) sur des bacs étanches et à l'abri des intempéries (pluie, neige). Aucune manipulation ou stockage n’est fait en dehors de ces aires. Le petit matériel est approvisionné à l’aide de jerricans, lesquels sont stockés après utilisation dans un container sur bac de rétention étanche. Le stationnement, les opérations de ravitaillement, de nettoyage et de vidange des engins de chantier sont réalisés conformément aux dispositions de l’article 24.1 du présent arrêté. Protection du captage du Bois d’Anthy en phase chantier Les mesures de protection du captage visant à prévenir une pollution en phase chantier, en accord avec l’avis de l’hydrogéologue agréé du 4 juin 2025, devront être mises en œuvre (MR52). ARTICLE 26.3 Caractéristiques des ouvrages de gestion des eaux pluviales définitifs La gestion des eaux pluviales est réalisée en système séparatif. Le dispositif est constitué d’un réseau de collecte et de 14 bassins de rétention dimensionnés pour une période de retour de 10 ans. Les caractéristiques de chacun des ouvrages de rétention et leur localisation sont présentées en annexe 15. Ils sont notamment équipés : - d’un volume de confinement permettant d’assurer l’isolement d’une pollution accidentelle et répondant aux caractéristiques techniques données à l’annexe 15 ; - d’un volume mort situé entre le fond du bassin et la génératrice inférieure de l’orifice de fuite. La hauteur du volume mort est de 50 cm minimum ; - d’une grille destinée à retenir les principaux flottants (déchets, …) susceptibles d’obstruer l’orifice de sortie calibré et le passage siphoïde ; - d’un système siphoïdal permettant de retenir l’essentiel des surnageants (hydrocarbures et corps flottants) ; - d’un débit de fuite limité à 6 l/s/ha ; - d’un dispositif de vannage permettant, en cas de pollution accidentelle, son confinement dans le bassin, commandé à distance pour les bassins 157 et 158 et manuellement pour les autres bassins ; - d’un dispositif complémentaire de traitement assuré par la mise en place d’un filtre à sable en sortie de décantation (pour 9 bassins sur 12) avant rejet dans un milieu sensible ; - d’une surverse intégrée à l’ouvrage de sortie en cas d’absence de filtre à sable à la sortie de l’ouvrage. 58 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 61
Gestion des eaux pluviales du centre d’entretien et d’intervention (CEI) de Machilly Les eaux pluviales du CEI, intégrant les surfaces actives du CEI, sont orientés vers 3 séparateurs à hydrocarbures et dirigées par une conduite vers l’ouvrage BAS 009 dimensionné pour recevoir l’ensemble ou, s’il y a un risque avéré pour le milieu naturel (dégradation de la qualité de l’eau du milieu récepteur ou capacité insuffisante de dilution), vers le réseau d’eaux pluviales le plus proche, en accord avec son gestionnaire. Gestion des eaux pluviales des aires de covoiturage • Les eaux pluviales des aires de Machilly et de Genevray sont infiltrées via des noues d’infiltration associées à des plantations phyto-épuratrices. • Les eaux pluviales de l’aire de Perrignier sont récoltées dans le bassin de rétention du diffuseur de Perrignier. Des collecteurs sont implantés si nécessaires pour diriger les eaux vers un exutoire situé sur la parcelle. ARTICLE 26.4 Gestion et suivi des ouvrages de gestion des eaux pluviales en phase d’exploitation Les bassins de rétention sont équipés d’une vanne d’entrée et d’une vanne de sortie, d’un by-pass en entrée, permettant de piéger les pollutions accidentelles dans le bassin. Un by-pass permet aux eaux pluviales arrivant dans un second temps de contourner le bassin. Un ouvrage siphoïde est installé en sortie du bassin. En phase d’exploitation : • les fossés imperméabilisés doivent être entretenus régulièrement, notamment en cas d’érosion des argiles. Des inspections visuelles ont lieu chaque année et des mesures correctives (remise en place d’argiles) sont mises en œuvre en cas de désordres observés (MR21) ; • avant entretien des bassins de rétention, réaliser un passage écologue pour vérifier la non- colonisation du bassin par des espèces, déplacement des individus si nécessaires et proposition d’un planning d’intervention (MR19). Perméabilité des bassins En cas d’implantation en zone de forte à très forte vulnérabilité du milieu souterrain (nappe affleurante ou périmètre de captage), le fond et les parois des ouvrages de rétention ainsi que le volume mort sont rendus imperméables afin d’éviter un transfert des polluants vers le milieu souterrain. Dans les secteurs sensibles aux remontées de nappe, les bassins de rétention munis d’un dispositif limitant la perméabilité de l’ouvrage (géomembrane ou revêtu béton) sont équipés d’un système spécifique (drains, clapets, ou lestage) pour maintenir le dispositif imperméabilisant en place et garantir le bon fonctionnement de l’ouvrage. Protection du captage Bois d’Anthy en phase exploitation En phase d’exploitation, l’assainissement routier est étanche dans la traversée des périmètres de protection du captage d’abduction d’eau potable (AEP) du Bois d’Anthy (MR53 et 54) et le système de retenue en tête de remblai du vallon des Eply (GBA) est vérifié voire adapté si nécessaire à l’évolution du trafic poids lourd (MR53). En phase d’exploitation, un plan d’alerte et de secours est prévu. Le bénéficiaire procède à un exercice pollution dans l’année suivant la mise en service de l’autoroute et avec l’ensemble des parties prenantes. Cet exercice est répété tous les 5 ans. Le bénéficiaire a la charge de former et sensibiliser annuellement ses équipes susceptibles d’intervenir en cas d’évènement. Thonon agglomération est associée tant en phase chantier qu’en phase d’exploitation, à toutes mesures de protection de la ressource en eau du captage AEP du Bois d’Anthy. 59 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 62
Assainissement du centre d'entretien et d'intervention (CEI) Dans un objectif de sécurisation de la qualité des rejets au milieu naturel, le CEI de Machilly est raccordé au réseau public d'assainissement pour les eaux usées : • traitement des eaux usées sanitaires par raccordement au système collectif en service route de Couty ; • traitement des eaux usées issues des aires de lavages et de la plateforme de stockage du sel par raccordement au système collectif en service route de Couty. Gestion des eaux pluviales sur les aires de covoiturage Le revêtement des places de stationnement est rendu perméable en l'absence d'un enjeu de vulnérabilité du milieu, à l'exception : • du parking de Machilly, implanté sur l'ancienne RD1206 ; • du parking de Perrignier, pour lequel la sensibilité du milieu récepteur justifie le maintien d'un revêtement imperméable afin de prévenir tout risque de pollution accidentelle. Le parking de Genevray est réalisé avec des places de stationnement en revêtement perméable, à l'exception des places réservées aux personnes à mobilité réduite (PMR). Les réseaux d’eaux pluviales et d’eaux usées seront réalisés en conformité avec les prescriptions des règlements du service des eaux pluviales d’Annemasse Agglomération pour l’aire de Machilly et de Thonon Agglomération pour les aires de Perrignier et de Genevray. Surveillance et entretien des bassins d’eaux pluviales en exploitation 12 caméras vidéo sont réparties sur l'ensemble du tracé et permettent à l'exploitant une surveillance 24h/24 via le PC sécurité, qui est en relation directe avec le SDIS. Le SDIS est associé aux différentes phases de conception détaillée, d'essais et de mise en service du projet (article 14). Le temps d’intervention du gestionnaire en cas de pollution accidentelle est réputé inférieur à 2h. Le service eau-environnement de la DDT en est immédiatement informé (ddt-see@haute- savoie.gouv.fr). En phase d’exploitation, un entretien régulier est réalisé par le gestionnaire autoroutier : • les filtres sont nettoyés ou remplacés dès qu’ils dysfonctionnent (colmatage ou autre). Un curage du volume mort est effectué avant que celui-ci soit comblé ; • les matériaux pollués sont évacués et éliminés selon les prescriptions de la réglementation en vigueur sur la base d’une analyse préalable de leur composition physico-chimique. Un carnet d’entretien et de suivi par ouvrage est complété par le gestionnaire de cet ouvrage et fourni au service eau-environnement de la DDT, à sa demande lors de contrôles inopinés. Y figurent les dates, les interventions, la rapidité d’intervention, les quantités et la destination des produits évacués. Au-delà des visites de contrôles régulières, le bénéficiaire fait réaliser une inspection détaillée de l’ouvrage tous les 6 ans par un bureau de contrôle indépendant et s’assure de son bon fonctionnement (colmatage, fissures, fuites, problème d’enracinement de la végétation…) et remédie aux dysfonctionnements. Suivi physico-chimique et gestion des pollutions Le suivi de la qualité physico-chimique des rejets est répété a minima 2 fois par an les 5 premières années d’exploitation puis une fois par an en cas d’absence de dysfonctionnement : • en période hivernale (représentation d’une pollution chronique et des sels dissous) ; • lors d’une pluie intervenant après une période sèche (type pollution choc). Les prélèvements sont réalisés : • au droit de l’exutoire du rejet de l’ouvrage de régulation ; • dans le milieu récepteur (cours d’eau) sur maximum 10 m en amont du point de rejet ; • dans le milieu récepteur (cours d’eau) sur maximum 10 m en aval du point de rejet. Les analyses portent sur les paramètres MES, DCO, DBO5, Pb, Cu, Cd, Zn, NaCl, hydrocarbures totaux, dureté de l’eau, pH et les éventuels autres polluants suspectés. 60 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 63
Les prélèvements pour le suivi régulier sont réalisés par un laboratoire accrédité COFRAC (comité français d’accréditation). Les résultats des analyses sont conservés par l'exploitant pendant une durée minimale de dix ans et tenus à la disposition des services chargés du contrôle. En cas de suspicion de pollution, des prélèvements sont réalisés le jour-même selon les mêmes modalités. La DDT peut demander à ce que le bénéficiaire réalise à ses frais une mesure de suivi du peuplement piscicole du milieu récepteur en fonction de la qualité des rejets d'eaux pluviales. En cas de pollution avérée, des mesures correctives sont prises immédiatement. Les interprétations de l’impact du rejet sur le milieu récepteur s’appuient sur les différents seuils de classe de qualité présentés en annexe 16. En phase d’exploitation, la qualité des rejets de chaque ouvrage de gestion des eaux pluviales est inférieure aux valeurs du tableau présenté en annexe 17. Si un des paramètres mesurés à l’aval du point de rejet déclasse ou dégrade la qualité écologique du milieu récepteur (cours d’eau) mesurée en amont, ou dépasse le seuil de l’état physico-chimique du milieu, le bénéficiaire informe sans délai le service de la police de l’eau de la DDT (ddt-see@haute-savoie.gouv.fr) ainsi que le service départemental de l’OFB (sd74@ofb.gouv.fr) de son constat et de la localisation précise du dysfonctionnement. Le bénéficiaire dispose de maximum 8 jours pour proposer des mesures correctives. Pour l'évaluation des paramètres relatifs à la qualité des cours d'eau, le bénéficiaire se réfère à la grille du Système d'évaluation de la qualité de l'eau des cours d'eau (SEQ-Eau). Rejet de sels routiers L’exploitant met en place une optimisation des pratiques de traitement des chaussées par les produits de déverglaçage dans le but de réduire l’usage des fondants et l’incidence potentielle sur les milieux récepteurs : • utilisation de la saumure de sodium (mélange d’eau et de sel dilué à 27%) qui permet de limiter l’usage de sel sec ; • salage préventif et curatif ciblés : l’implantation d’une station météorologique routière dotée de capteurs de chaussées qui fournissent des données précises sur la température de la chaussée, l'humidité, ainsi que son taux de protection permet d'appliquer les traitements au bon moment et en juste quantité, sous forme de saumure liquide ; • utilisation de véhicules de salages à dosage précis : les nouvelles épandeuses modernes sont dotées de systèmes GPS et de capteurs qui ajustent la quantité de saumures de sodium épandue en fonction de la vitesse du véhicule, de la largeur de la voie et des conditions. Le bénéficiaire de l’autorisation complète l’analyse des incidences des rejets de sel par retour d’expérience d’exploitation sur le suivi de la dissolution des différents produits de déverglaçage le long de la chaîne de « traitement » du système d’assainissement des chaussées y compris dans les exutoires, en qualité et quantité. Un bilan physico-chimique est transmis au service eau- environnement de la DDT (ddt-see@haute-savoie.gouv.fr) à n+5, n+10, n+20, n+35 et n+55 après l’ouverture à l’exploitation. Autour et dans les bassins, le gestionnaire réalise également l’entretien régulier des espaces verts (tonte, fauchage, broyage, évacuation des déchets plastiques, surveillance de l’état général, de manière à éviter le développement d’arbustes dans les bassins fragilisant la perméabilité de la structure (béton, géomembranes) et limitant l’évacuation des boues, et l’installation d’espèces végétales envahissantes. Ces opérations font l’objet d’un plan d’entretien adapté selon les périodes de l’année. 61 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 64
ARTICLE 26.5 Petits ouvrages de rétablissement des écoulements naturels (POH) Les fossés et conduites associées permettant le rétablissement des bassins versants naturels vers un exutoire ont été dimensionnés pour le débit de pointe décennal (Q10). Si ce dimensionnement est insuffisant pour le respect de l’article 640 du code civil (le propriétaire supérieur ne peut rien faire qui aggrave la servitude du fonds inférieur), alors le dimensionnement adéquat doit être réalisé par le bénéficiaire et mis en œuvre à ses frais. ARTICLE 27 Zones humides Le présent article fixe les prescriptions spécifiques applicables au projet pour prévenir, éviter, réduire, suivre et, le cas échéant, compenser les incidences directes et indirectes sur les zones humides au sens des articles L. 211-1 et R. 211-108 du code de l’environnement. Ces prescriptions s’appliquent à l’ensemble des emprises définitives, emprises temporaires, zones d’occupation de chantier, ouvrages hydrauliques, secteurs de déblais-remblais, bassins, zones de rescindement de cours d’eau et sites de compensation en lien fonctionnel avec les zones humides affectées par le projet. La localisation des zones humides impactées par le projet est donnée à l’annexe 18. La localisation des mesures d’évitement et de réduction associées aux zones humides est donnée à l’annexe 19. ARTICLE 27.1 Délimitation opposable et principe de non-aggravation Avant tout commencement de travaux, le bénéficiaire transmet au service chargé de la police de l’eau un plan de délimitation consolidé, à l’échelle 1/5000, des zones humides affectées, évitées, restaurées, recréées et compensées, distinguant les impacts directs, indirects, temporaires et permanents (ME3, ME4, ME5, MR21, MR22, MR23, MR24, MA10 et l’ensemble des MCZH), en complément des dispositions de l’article 24.6 du présent arrêté. Cette délimitation est établie à partir des pièces du dossier, actualisées si nécessaire par des investigations complémentaires. Lorsqu’un doute subsiste sur la caractérisation d’un secteur humide ou sur l’étendue d’un effet drainant ou de déconnexion hydraulique, le bénéficiaire procède à des vérifications complémentaires, comprenant des investigations pédologiques en plus de l’analyse botanique chaque fois que cela est nécessaire pour sécuriser la qualification du milieu. Aucune emprise nouvelle, même temporaire, aucune modification technique d’exécution, aucun accès chantier, aucune piste, aucun stockage, aucun dépôt ni aucun ouvrage provisoire ne peut être implanté dans une zone humide évitée ou dans sa zone d’alimentation. ARTICLE 27.2 Mise en défens et organisation du chantier Les zones humides évitées, ainsi que les secteurs humides sensibles situés en périphérie immédiate des travaux, sont mis en défens avant toute intervention par un balisage physique continu, visible et maintenu pendant toute la durée du chantier (ME 3 et 5). Les installations de chantier, pistes, aires de retournement, plateformes de stockage, fossés provisoires, bassins temporaires de traitement des eaux de chantier et zones de dépôt de terres sont implantés hors zones humides évitées et hors secteurs de susceptibilité d’alimentation hydrologique des zones humides évitées. Le bénéficiaire tient à jour un plan de circulation chantier opposable aux entreprises, accompagné d’un plan des zones interdites. Tout franchissement non autorisé d’une mise en défens, tout dépôt de matériaux ou toute atteinte accidentelle à une zone humide fait l’objet d’un signalement sous 62 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 65
24 heures au service de police de l’eau et à l’OFB, assorti d’une proposition de remise en état immédiate. ARTICLE 27.3 Prévention des effets drainants et des déconnexions hydrauliques Le bénéficiaire met en œuvre, avant ouverture généralisée des terrassements, l’ensemble des dispositifs nécessaires pour éviter l’assèchement des zones humides attenantes en amont des emprises et la déconnexion hydraulique des parties aval, y compris lorsque ces effets sont induits par des fossés de collecte, déblais, couches drainantes, ouvrages linéaires ou emprises temporaires. Les zones humides identifiées comme susceptibles d’être affectées indirectement par drainage ou déconnexion sont traitées comme des zones humides impactées à part entière pour l’application des obligations de suivi, de correction et, le cas échéant, de compensation. La seule absence d’emprise physique directe ne vaut pas démonstration d’absence d’impact. Pour les secteurs faisant l’objet d’une mesure spécifique de limitation d’un masque drainant ou d’un terrassement sensible, notamment la zone humide n°32 ou tout secteur équivalent issu des études d’exécution, le bénéficiaire met en place, avant travaux, un suivi piézométrique et botanique de référence, d’une durée minimale de douze mois, sauf si une durée différente est expressément validée par le préfet sur justification technique circonstanciée fondée sur des séries de mesures déjà acquises et jugées suffisantes par le service de police de l’eau. ARTICLE 27.4 Prescriptions particulières pour les sites du Grand marais de Margencel et le cuvelage d’Allinges Le Grand marais de Margencel constitue un secteur à enjeu majeur dont l’évitement hydraulique et fonctionnel est une condition substantielle de la présente autorisation. Le bénéficiaire met en œuvre, avant tout terrassement susceptible d’influencer le fonctionnement hydrogéologique du secteur de Mésinges, le dispositif comprenant au minimum la collecte des eaux interceptées et leur réinfiltration en aval du projet et en amont du Grand marais, ainsi que toute disposition utile au maintien de la piézométrie et à la non-dégradation de la qualité des eaux alimentant le marais. Un cuvelage étanche et un drain écrêteur en tête des parois moulées seront réalisés à l’issue des travaux de terrassement. Un réseau de suivi quantitatif et qualitatif est maintenu pendant toute la phase travaux puis pendant toute la durée d’exploitation sur les secteurs d’Allinges et de Margencel. Il comprend a minima : des piézomètres de référence amont, des piézomètres de contrôle en secteur d’influence, des mesures de niveau, de conductivité, de température, de pH, de MES, d’hydrocarbures, ainsi que tout paramètre pertinent au regard du fonctionnement du marais et de la qualité des eaux réinjectées. Au terme d’une période minimale de dix ans d’exploitation, le bénéficiaire établit un bilan de ce suivi. Sur la base de ce bilan et sur demande dûment justifiée, les modalités et la fréquence du suivi peuvent être adaptées après accord des services de l’État compétents. Le bénéficiaire transmet au service police de l’eau et à l’OFB un protocole détaillé de suivi, les seuils d’alerte, les modalités d’interprétation et les mesures correctives associées, avant le démarrage des travaux. Toute dérive confirmée révélant un rabattement anormal, une dégradation de la qualité des eaux ou une altération des conditions de fonctionnement du marais entraîne la mise en œuvre immédiate de mesures conservatoires et correctives, sans attendre la production du rapport périodique suivant. ARTICLE 27.5 Compensation des atteintes aux zones humides La localisation des mesures de compensation des atteintes aux zones humides est présentée à l’annexe 4. 63 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 66
Les atteintes résiduelles aux zones humides donnent lieu à une compensation surfacique et fonctionnelle fondée sur la méthode nationale d’évaluation des fonctions des zones humides dans sa version en vigueur, appliquée par grands types de systèmes hydrogéomorphologiques, de manière à rendre lisibles les équivalences recherchées par sous-fonction hydrologique, biogéochimique et biologique (MCZH 01, 02, 03, 04, 05, 06, 07). Les modalités techniques détaillées de mise en œuvre sont arrêtées dans les plans de gestion des sites compensatoires, élaborés en concertation avec l’ONF lorsqu’ils concernent des espaces relevant du régime forestier. Aucun ratio forfaitaire uniforme ne peut se substituer à cette démonstration fonctionnelle. Le bénéficiaire précise, pour chaque site compensatoire, les surfaces sécurisées, les fonctions perdues sur les sites impactés, les gains attendus, les délais d’atteinte, les risques d’échec, les facteurs limitants, la localisation par bassin versant et les garanties de maîtrise foncière et de gestion pérenne. Les habitats humides à très forte valeur patrimoniale, notamment les bas-marais alcalins et complexes tourbeux dont la compensation présente des limites majeures ou une faisabilité insuffisamment démontrée, doivent faire l’objet d’une priorité absolue à l’évitement. Si des études d’exécution faisaient apparaître une incidence résiduelle non anticipée sur de tels milieux, les travaux du secteur concerné sont suspendus jusqu’à réexamen préfectoral. ARTICLE 27.6 Plans de gestion et sécurisation des sites compensatoires Pour chaque site compensatoire zones humides, le bénéficiaire adresse au préfet (DDT) et à l’OFB, au plus tard six mois après le début de la mise en œuvre des travaux de compensation, un plan de gestion comprenant a minima l’état initial complet, les objectifs écologiques et hydrologiques, les modalités techniques, le calendrier, les indicateurs de résultats, les seuils d’alerte, les modalités de gestion adaptative, les engagements fonciers et la durée de protection du site. Concernant les sites situés en forêts communales, le maître d’ouvrage propose la conclusion de conventions spécifiques avec l’ONF pour l’élaboration et la mise en œuvre des plans de gestion des sites mentionnés dans son avis, en intégrant les prescriptions techniques et les adaptations demandées par l’ONF, notamment celles relatives aux sites de Bons-en-Chablais, Allinges et Loisin, ainsi que les exigences de gestion compatibles avec le régime forestier. ARTICLE 27.7 Suivi, bilans et mesures correctives Le bénéficiaire met en place un suivi hydrologique, pédologique, botanique et fonctionnel de l’ensemble des zones humides évitées situées à proximité directe du projet, restaurées, recréées et compensées. La localisation de ces zones humides devra être transmise préalablement aux services instructeurs de la DDT de Haute-Savoie (ddt-see@haute-savoie.gouv.fr). Ce suivi comprend au minimum un état initial, un suivi en phase travaux, un suivi aux années n+1, n+3, n+5, n+7, n+10, puis tous les cinq ans pendant 30 ans pour les sites compensatoires. Les bilans de suivi intègrent les résultats de la méthode nationale d’évaluation des fonctions des zones humides, l’évolution des paramètres piézométriques, l’état de la végétation hygrophile, la présence d’espèces exotiques envahissantes, l’état des connexions hydrauliques et toute altération observée du caractère humide. Si les objectifs de maintien, de restauration ou de gain fonctionnel ne sont pas atteints, le bénéficiaire met en œuvre sans délai des mesures correctives ou compensatoires additionnelles, portant selon les cas sur les profils hydrauliques, les alimentations en eau, la gestion des ouvrages, la lutte contre les espèces exotiques envahissantes, la restauration de sols hydromorphes, ou l’extension du foncier compensatoire. 64 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 67
ARTICLE 27.8 Contrôles et suspension des travaux Le préfet (le service en charge de la police de l’eau) et l’OFB peuvent à tout moment demander tout document justificatif, faire procéder à des contrôles contradictoires, imposer des investigations complémentaires ou ordonner l’arrêt immédiat des travaux sur un secteur donné lorsqu’un risque grave d’atteinte irréversible à une zone humide ou à son alimentation hydrologique est identifié. TITRE IV - PRESCRIPTIONS PARTICULIÈRES RELATIVES À LA DÉROGATION AU TITRE DE LA PROTECTION DES ESPÈCES ARTICLE 28 Objet de la dérogation Conformément aux engagements énoncés dans le dossier de demande et ses compléments, et sous réserve des dispositions du présent arrêté, le bénéficiaire (ou ci-après « l’exploitant ») est autorisé, ainsi que ses éventuels mandataires opérant dans le cadre de l’exécution des prescriptions du présent titre, à : • capturer, enlever, détruire et perturber intentionnellement des spécimens d’espèces animales protégées ; • détruire, altérer ou dégrader des sites de reproduction ou aires de repos d’espèces animales protégées ; • récolter, utiliser, transporter ou enlever des spécimens d’espèces végétales protégées ; tels que présenté dans les tableaux ci-après. L’exploitant s’assure du respect de l’ensemble des obligations qui lui sont faites de la part de l’ensemble des intervenants sur les chantiers concernés par la présente dérogation. ESPÈCES ANIMALES Nom commun et nom scientifique Transport, transport en vue de relâcher dans la nature, capture ou enlèvement de spécimens Destruction de spécimens Perturbation intentionnelle de spécimens Destruction, altération ou dégradation de sites de reproduction ou d’aires de repos AMPHIBIENS ET REPTILES Coronelle lisse (Coronella austriaca) X X X Couleuvre helvétique (Natrix helvetica) X X X Crapaud commun (Bufo bufo) X X X X Grenouille agile (Rana dalmatina) X X X X Grenouille rieuse (Pelophylax ridibundus) X X X X Grenouille rousse (Rana temporaria) X X X X Lézard à deux raies (Lacerta bilineata) X X X Lézard des murailles (Podarcis muralis) X X X X Lézard des souches (Lacerta agilis) X X X Orvet fragile (Anguis fragilis) X X X Salamandre tachetée (Salamandra salamandra) X X X X Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata) X X X X Triton alpestre (Ichthyosaura alpestris) X X X X Triton crêté (Triturus cristatus) X X X X Triton palmé (Lissotriton helveticus) X X X X 65 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 68
ESPÈCES ANIMALES Nom commun et nom scientifique Transport, transport en vue de relâcher dans la nature, capture ou enlèvement de spécimens Destruction de spécimens Perturbation intentionnelle de spécimens Destruction, altération ou dégradation de sites de reproduction ou d’aires de repos Vipère aspic (Vipera aspis) X X X INSECTES Cuivré des marais (Thersamolycaena dispar) X X Carabe noduleux (Carabus nodulosus) X X MAMMIFÈRES Barbastelle d’Europe (Barbastella barbastellus) X X X Castor d'Europe (Castor fiber) X X Chat sauvage (Felis silvestris) X X Écureuil roux (Sciurus vulgaris) X X Hérisson d'Europe (Erinaceus europaeus) X X X Loup (Canis lupus) X Lynx boréal (Lynx lynx) X Minioptère de Schreibers (Miniopterus schreibersii) (Miniopterus schreibersi) X X X Molosse de Cestoni (Tadarida teniotis) X X X Murin à moustaches (Myotis mystacinus) X X X Murin à oreilles échancrées (Myotis emarginatus) X X X Murin de Bechstein (Myotis bechsteinii) X X X Murin de Brandt (Myotis brandtii) X X X Murin de Daubenton (Myotis daubentonii) X X X Murin de Natterer (Myotis natterer) X X X Muscardin (Muscardinus avellanarius) X X X Noctule commune (Nyctalus noctula) X X X Noctule de Leisler (Nyctalus leisleri) X X X Oreillard gris (Plecotus austriacus) X X X Oreillard roux (Plecotus auritus) X X X Pipistrelle commune (Pipistrellus pipistrellus) X X X Pipistrelle de Kuhl (Pipistrellus kuhlii) X X X Pipistrelle de Nathusius (Pipistrellus nathusii) X X X Pipistrelle pygmée (Pipistrellus pygmaeus) X X X Sérotine bicolore (Vespertilio murinus) X X X Sérotine commune (Eptesicus serotinus) X X X Sérotine de Nilsson (Eptesicus nilssonii) X X X Vespère de Savi (Hypsugo savii) X X X OISEAUX Accenteur mouchet (Prunella modularis) X X Autour des palombes (Accipiter gentilis) X X 66 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 69
ESPÈCES ANIMALES Nom commun et nom scientifique Transport, transport en vue de relâcher dans la nature, capture ou enlèvement de spécimens Destruction de spécimens Perturbation intentionnelle de spécimens Destruction, altération ou dégradation de sites de reproduction ou d’aires de repos Bec-croisé des sapins (Loxia curvirostra) X X Bergeronnette des ruisseaux (Motacilla cinerea) X X Bergeronnette grise (Motacilla alba) X X Bergeronnette printanière (Motacilla flava) X X Bondrée apivore (Pernis apivorus) X X Bouvreuil pivoine (Pyrrhula pyrrhula) X Bruant des roseaux (Emberiza schoeniclus) X X Bruant jaune (Emberiza citrinella) X X Bruant zizi (Emberiza cirlus) X X Buse variable (Buteo buteo) X X Chardonneret élégant (Carduelis carduelis) X X Chevêche d'Athéna (Athene noctua) X X Chouette hulotte (Strix aluco) X X Cincle plongeur (Cinclus cinclus) X X Coucou gris (Cuculus canorus) X X Effraie des clochers (Tyto alba) X X Épervier d'Europe (Accipiter nisus) X X Faucon crécerelle (Falco tinnunculus) X X Faucon hobereau (Falco subbuteo) X X Faucon pèlerin (Falco peregrinus) X X Fauvette à tête noire (Sylvia atricapilla) X X Fauvette des jardins (Sylvia borin) X X Gobemouche gris (Muscicapa striata) X X Gobemouche noir (Ficedula hypoleuca) X X Grand Corbeau (Corvus corax) X X Grimpereau des jardins (Certhia brachydactyla) X X Grosbec casse-noyaux (Coccothraustes coccothraustes) X X Hibou moyen-duc (Asio otus) X X Hirondelle de fenêtre (Delichon urbicum) X X Hirondelle rustique (Hirundo rustica) X X Hypolaïs polyglotte (Hippolais polyglotta) X X Linotte mélodieuse (Carduelis cannabina) X X Locustelle tachetée (Locustella naevia) X X Loriot d'Europe (Oriolus oriolus) X X Martin pêcheur d'Europe (Alcedo atthis) X X 67 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 70
ESPÈCES ANIMALES Nom commun et nom scientifique Transport, transport en vue de relâcher dans la nature, capture ou enlèvement de spécimens Destruction de spécimens Perturbation intentionnelle de spécimens Destruction, altération ou dégradation de sites de reproduction ou d’aires de repos Martinet noir (Apus apus) X X Mésange bleue (Cyanistes caeruleus) X X Mésange boréale (Parus montanus) X X Mésange charbonnière (Parus major) X X Mésange huppée (Lophophanes cristatus) X X Mésange noire (Periparus ater) X X Mésange nonnette (Parus palustris) X X Milan noir (Milvus migrans) X X Milan royal (Milvus milvus) X X Moineau domestique (Passer domesticus) X X Moineau friquet (Passer montanus) X X Orite à longue queue (Aegithalos caudatus) X X Petit-duc scops (Otus scops) X X Pic épeiche (Dendrocopos major) X X Pic épeichette (Dendrocopos minor) X X Pic mar (Dendrocopos medius) X X Pic noir (Dryocopus martius) X X Pic vert (Picus viridis) X X Pie-grièche écorcheur (Lanius collurio) X X Pinson des arbres (Fringilla coelebs) X X Pipit des arbres (Anthus trivialis) X X Pipit farlouse (Anthus pratensis) X X Pipit spioncelle (Anthus spinoletta) X X Pouillot de Bonelli (Phylloscopus bonelli) X X Pouillot fitis (Phylloscopus trochilus) X X Pouillot véloce (Phylloscopus collybita) X X Roitelet à triple bandeau (Regulus ignicapilla) X X Roitelet huppé (Regulus regulus) X X Rossignol philomèle (Luscinia megarhynchos) X X Rouge-gorge familier (Erithacus rubecula) X X Rougequeue à front blanc (Phoenicurus phoenicurus) X X Rougequeue noir (Phoenicurus ochruros) X X Rousserolle effarvatte (Acrocephalus scirpaceus) X X Rousserolle verderolle (Acrocephalus palustris) X X Serin cini (Serinus serinus) X X 68 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 71
ESPÈCES ANIMALES Nom commun et nom scientifique Transport, transport en vue de relâcher dans la nature, capture ou enlèvement de spécimens Destruction de spécimens Perturbation intentionnelle de spécimens Destruction, altération ou dégradation de sites de reproduction ou d’aires de repos Sittelle torchepot (Sitta europaea) X X Tarier pâtre (Saxicola rubicola) X X Tarier des prés (Saxicola rubetra) X Tarin des aulnes (Carduelis spinus) X X Torcol fourmilier (Jynx torquilla) X X Troglodyte mignon (Trogodytes troglodytes) X X Verdier d'Europe (Chloris chloris) X X POISSONS Truite commune (Salmo truita) X ESPÈCES VÉGÉTALES Nom commun et nom scientifique Récolte, utilisation, transport, cession de spécimens Coupe, arrachage, cueillette ou enlèvement de spécimens Ail rocambole (Allium scorodoprasum) X Buxbaumie verte (Buxbaumia viridis) X Dicrane vert (Dicranum viride) X Œillet superbe (Dianthus superbus) X X ARTICLE 29 Périmètre de la dérogation L’exploitant se conforme strictement au périmètre défini dans le dossier de demande de dérogation et rappelé en annexe 2. ARTICLE 30 Prescriptions L ‘exploitant, ainsi que ses éventuels mandataires opérant dans le cadre de l’exécution des prescriptions du présent arrêté, respectent les engagements suivants, découlant du dossier de demande et de ses compléments, sous réserve des prescriptions listées dans les sous-articles 1 à 4 du présent article. L’annexe 20 précise la trame de restitution des fiches synthétiques de suivi pour les mesures ERCAS. L’ensemble des mesures est mis en œuvre sous le contrôle permanent du bénéficiaire de la dérogation, responsable administrativement de leur bonne mise en œuvre, qui assure le contrôle, le suivi et la coordination de la bonne mise en œuvre des mesures ERCAS nécessaires à l’atteinte des objectifs fixés par l’arrêté. Il définit et met en place au moment opportun, en lien avec les autres intervenants concernés, les outils adaptés nécessaires à l’atteinte des objectifs fixés par le présent arrêté. Les mesures suivantes sont numérotées au regard du dossier de demande. ARTICLE 30.1 Mesures d’évitement Le bénéficiaire met en œuvre les mesures d’évitement ci-dessous. 69 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 72
ME1 : Mise en défens des cours d’eau en faveur du Castor Les cours d’eau et leurs ripisylves sont mis en défens en présence d’un écologue, comme localisé en annexe 21, à l’aide d’une clôture provisoire qui répond aux caractéristiques suivantes : • hauteur comprise entre 1 m et 1,20 m ; • installée en retrait de la berge à 2 m du bord de l’eau ; • ancrage dans le sol par des piquets bois enfoncés sur 40 à 50 cm, avec un espacement de 3 m entre les piquets. Une signalétique claire est apposée régulièrement afin de garantir la lisibilité auprès de tous les intervenants du chantier. Les secteurs à mettre en défens sont délimités par une corde fluorescente en amont des travaux de déboisement et en présence d’un écologue. Le balisage est maintenu pendant toute la durée des travaux préparatoires et fait l’objet d’un entretien régulier en tant que de besoin. La mise en défens est mise en place à l’issue des travaux de déboisement et est entretenue tout au long des travaux. Elle fait l’objet d’un entretien régulier tant que de besoin, puis est retirée en fin de chantier. Au sein de cette zone, la circulation des engins et des personnes est strictement interdite. ME2 : Mise en défens des stations botaniques patrimoniales Les stations d’espèces végétales protégées situées à moins de 50 m de la limite du chantier, localisées en annexe 22, sont mises en défens en présence d’un écologue à l’aide d’une barrière physique visible (piquets colorés, corde résistante, etc.). La mise en défens est mise en place en amont du démarrage des travaux et est entretenue tout au long de ceux-ci. Elle fait l’objet d’un entretien régulier en tant que de besoin, puis est retirée en fin de chantier. Une signalétique est installée afin d’informer clairement les intervenants du chantier. ME3 : Encadrement rigoureux des travaux L’emprise des travaux est strictement délimitée par une corde fluorescente en amont du démarrage du chantier et en présence d’un écologue pour éviter tout débordement de l’emprise chantier. Le balisage est maintenu tout au long de la phase préparatoire et fait l’objet d’un entretien régulier en tant que de besoin, puis est remplacé à l’issue des travaux de déboisements par une barrière physique maintenue tout au long des travaux et faisant l’objet d’un entretien régulier en tant que de besoin, puis retirée en fin de chantier. Au sein de la zone travaux, la circulation des engins est optimisée avec un tracé de moindre impact. Les voies d’accès font l’objet d’un entretien régulier pour éviter la création d’ornières sur les zones chantier (voir MR9). ME5 : Évitement des zones humides lors de la conception du projet Se référer aux prescriptions générales sur le sujet (article 27). Cette mesure est localisée en annexe 19. 70 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 73
ARTICLE 30.2 Mesures de réduction Le bénéficiaire met en œuvre les mesures de réduction ci-dessous. MR1 : Adaptation du calendrier et techniques des travaux • Déboisements (MR1.a) : Les travaux d’abattage et de débroussaillage sont réalisés en présence d’un écologue entre le 1er septembre et le 28 février. La veille des opérations, l’écologue réalise une inspection à l’endoscope des arbres à potentialités pour les chiroptères. En cas de présence d’individus au sein des cavités, les travaux d’abattage de ces arbres sont reportés entre le 1er septembre et le 31 octobre. En cas de réalisation des opérations en janvier ou février, l’écologue s’assure de l’absence de potentialité ou d’occupation par l’avifaune cavicole (pics, rapaces nocturnes) avant tout abattage. Le déboisement s’effectue par phases centrifuges. Le chantier est découpé en sous-secteurs d’intervention afin de favoriser et de diriger la fuite spontanée de la faune vers des zones non remaniées. L’écologue en charge du suivi du chantier réalise des contrôles à l’avancement afin d’identifier les arbres à enjeux non détectés initialement, d’ajuster les modalités de coupe ou de phasage et de renforcer les mesures de précautions. Une bande de 4 m de zone déboisée non dessouchée est appliquée pour des contraintes de sécurité. Lorsque ce corridor est situé en zone humide, le déboisement est réalisé depuis l’axe de l’autoroute afin de minimiser l’intervention d’engins mécaniques. • Travaux en cours d’eau (MR1.b) : Hors zones boisées, les travaux en cours d’eau sont réalisés entre le 1er juillet et le 31 octobre. En dehors de cette période, les travaux ne sont réalisés qu’en cas de nécessité technique après validation d’un écologue et information de la DDT de Haute-Savoie (ddt-see@haute-savoie.gouv.fr) et de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) (article 24.1). Une bande rivulaire végétalisée de 2 m est préservée en berge non impactée afin de garantir des habitats refuges pour la faune. Les accès au chantier et le tracé des pistes sont adaptés afin d’éviter les zones à forte sensibilité écologique. Une pêche électrique est réalisée avant toute intervention en lit mineur (voir MR16). En cas de découverte d’une frayère active, les mesures suivantes sont mises en œuvre : ◦ création d’un périmètre de protection d’un rayon supérieur à 10 m : toute intervention ou modification hydraulique y est proscrite ; ◦ report des travaux en cours d’eau à une date compatible avec la fin du cycle ; ◦ réduction du débit de rejet de l’assainissement provisoire à proximité le cas échéant, fin de limiter le risque de turbidité. En cas de découverte d’un site de reproduction du Martin-pêcheur, les mesures suivantes sont mises en œuvre : ◦ arrêt des travaux sur la berge concernée dans un rayon minimal de 20 m défini par l’écologue, avec information de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal- ara@developpement-durable.gouv.fr) ; ◦ reprise des travaux uniquement après envol confirmé par un écologue. 71 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 74
• Travaux sur bâti (MR1.c) : Les travaux de démolition des bâtiments sont réalisés entre le 1er septembre et le 31 octobre. En cas de difficultés techniques, cette période peut être prolongée jusqu’au 28 février sous réserve de la validation de l’écologue et après information de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal- ara@developpement-durable.gouv.fr). Avant le démarrage des travaux de démolition des bâtiments, des gîtes de substitution sont mis en place à proximité de la zone travaux et une défavorabilisation préalable des bâtiments est mise en œuvre en présence de l’écologue en charge du suivi du chantier selon les modalités suivantes : ◦ réalisation d’un contrôle des bâtiments identifiés par inspection visuelle des structures connues à enjeux (combles, fissures, linteaux, etc.), complété par 2 nuits d’écoutes actives et d’une observation thermique ; ◦ obstruction progressive des accès en maintenant des sorties unidirectionnelles ; ◦ mise en place d’une perturbation douce en dehors des périodes sensibles : retrait progressif des éléments de couverture (tuiles, ardoises), création de courant d’air et ouverture ciblée d’issues, enlèvement des éléments extérieurs susceptibles de constituer des refuges potentiels ; ◦ retrait des éléments attractifs (anciens nids, isolants thermiques etc.). L’écologue en charge du suivi du chantier s’assure ensuite de l’absence d’individus avant les travaux de démolition. Si la présence d’individus est constatée, les travaux sont reportés jusqu’à ce qu’un ajustement de la méthode de perturbation douce soit validé par la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). En cas de découverte d’un individu bloqué, les accès sont immédiatement ré-ouverts. MR3 : Limitation des nuisances lumineuses et acoustiques Les travaux de nuit sont proscrits dans les zones sensibles localisées en annexe 23. En cas d’urgence relative à un danger pour les biens ou les personnes, des travaux de nuit peuvent être conduits en présence d’un écologue et après information de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal- ara@developpement-durable.gouv.fr). Les équipes chantier sont sensibilisées aux effets du bruit sur la faune : réduction des klaxons, modération des alarmes de recul, arrêt moteur à l’arrêt. MR4 : Réduction de la vitesse des engins Dès l’installation du chantier et jusqu’à la réalisation de la couche de forme, la vitesse maximale autorisée au sein des emprises chantier est de 50 km/h pour tous les engins. Au droit des zones sensibles (secteurs boisés et boisements humides), localisées en annexe 23, la vitesse maximale autorisée est de 20 km/h. Une signalisation dédiée est mise en place aux entrées de ces zones puis tous les 300 m. La consigne est rappelée à chaque réunion de sécurité et le plan de circulation est affiché au sein de la base vie. MR6 : Création de dispositifs de rétablissement des continuités écologiques L’ensemble des aménagements suivants, localisé en annexe 24, est réalisé avant la fin des travaux. Il fait l’objet d’un entretien régulier durant toute la phase d’exploitation. • Passages toute faune (MR6.a) : 2 écoponts sont mis en place au niveau de corridors forestiers selon les modalités suivantes : ◦ PTF18 : un ouvrage de 30 m de large et long de 26 m est créé à l’ouest de la ZAE des Bracots ; 72 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 75
◦ PTF144 : un ouvrage de 25 m de large et long de 26 m est créé au sud du lieu-dit de Dursilly. Cet aménagement possède une double fonctionnalité passage à faune et chemin rural, ces deux espaces sont divisés par une séparation opaque limitant ainsi les perturbations ; ◦ les ouvrages sont aménagés en pente douce à leur extrémité afin de faciliter l’accès à la faune ; ◦ le tablier est recouvert de terre végétale ; ◦ des plantations d’espèces appétentes sont mises en œuvre au sein des ouvrages ; ◦ des plantations d’arbres de haut jet sont mises en œuvre à chaque extrémité des ouvrages ; ◦ des haies arbustives sur 2 rangs sont implantées au sein des ouvrages afin de créer un écran végétal et un corridor linéaire à suivre ; ◦ des écrans latéraux opaques en bois sont mis en place de part et d’autre des ouvrages afin de limiter les nuisances issues de l’autoroute ; ◦ les entrées et sorties des ouvrages sont aménagées en cônes inversés afin d’éviter l’effet tunnel et sont constituées de blocs rocheux anti-intrusion espacés d’un mètre entre eux. Les schémas d’aménagements de ces ouvrages sont illustrés en annexe 25. 3 rétablissements routiers supérieurs avec fonction de passage à faune d’une largeur de 7 m et long de 54 m sont créés au niveau des chemins du Bois de la Porte (PS22), Blessenys (PS92) et des Bougeries (PS110). Des occultants latéraux de 1,20 m de hauteur sont mis en place sur les dispositifs de sécurité. Un nouvel ouvrage identique au viaduc du Pamphiot est réalisé à son côté afin de maintenir à l’identique un passage toute faune sous l’infrastructure autoroutière. 8 ouvrages hydrauliques avec fonction de passages inférieurs toute faune sont mis en place selon les modalités suivantes : ◦ conservation du lit du cours d’eau et des berges existantes pour les ouvrages : ▪ OH54 : 44 m de large, long de 25 m (± 50 cm) et haut de 4,5 m, au niveau du ruisseau du Passage ; ▪ OH59 : 40 m de large, long de 25 m (± 50 cm) et haut de 4 m, au niveau du ruisseau des Gotales ; ▪ OH68 : 41 m de large, long de 25 m (± 50 cm) et haut de 4 m, au niveau du ruisseau d’Avully ; ▪ OH82 : 40 m de large, long de 25 m (± 50 cm) et haut de 7 m, au niveau du ruisseau de la Gorge ; ▪ OH124 : 81 m de large, long de 25 m (± 50 cm) et haut de 6 m, au niveau de la rivière du Redon ; ◦ reconstitution du lit du cours d’eau et stabilisation des berges selon des techniques de génie végétal, pour les ouvrages : ▪ OH63 : 15 m de large, long de 30 m (± 50 cm) et haut de 6 m, au niveau du ruisseau du Foron de Sciez ; ▪ OH72 : 7 m de large, long de 32 m (± 50 cm) et haut de 4,5 m, au niveau du ruisseau des communs. 2 banquettes latérales de 1 m de large en rive gauche et droite sont mises en place à 30 cm au-dessus du cours d’eau. L’accès à ces banquettes depuis la berge ou le lit du ruisseau est rendu possible par la réalisation d’un talus incliné (pente inférieure à 30%) ; ◦ PI135 : un passage inférieur de 7 m de large, long de 34 m (± 50 cm) et haut de 4,4 m est créé au niveau du VC8 des marais Dursilly / BVN d’Allinges. Des clôtures de guidage sont installées de part et d’autre de tous les passages grande faune (écoponts, passages inférieurs toute faune) avant la mise en service de l’autoroute, selon les caractéristiques techniques suivantes : ◦ longueur de guidage : 200 m de chaque côté du passage afin de canaliser les déplacements des grands mammifères ; ◦ hauteur : supérieure à 2 m ; ◦ maille renforcée : inférieure ou égale à du 5 x 5 cm ; ◦ la clôture est enterrée sur au moins 50 cm afin d’empêcher le creusement ; 73 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 76
◦ la clôture est constituée d’un retour en « L » (bavolet de 30 à 50 cm vers l’extérieur) avec mise en place de barbelés ou rouleaux en haut, afin d’empêcher la faune de grimper et de franchir la clôture ; ◦ des écrans végétalisés sont mis en place en complément. Des clôtures spécialisées pour le Lynx boréal sont mises en place au niveau du PTF18 (voir MA03), et pour tout passage à faune dont le suivi révélerait une utilisation par le Lynx. L’ensemble des plantations sont effectuées avec des espèces issues de la marque « Végétal local » ou équivalent. • Passages petite et moyenne faune (MR6.b) : 8 passages inférieurs pour la petite faune, larges de 1,90m, sont mis en place selon les modalités suivantes : ◦ hauteur de 2 m : ▪ PPF32 : long de 48 m (± 50 cm), au niveau du boisement à l’ouest de la ZAE des Bracots ; ▪ PPF124 : long de 40 m (± 50 cm), au niveau du boisement au sud de la ZA de Mésinges ; ◦ hauteur de 1,50 m : ▪ PPF36 : long de 40 m (± 50 cm), au niveau du boisement au nord de la ZAE Les Bougeries ; ▪ PPF81 : long de 38 m (± 50 cm), au sud-ouest de « Chez Jacquier » ; ▪ PPF115 : long de 39 m (± 50 cm), au niveau du boisement au nord de la ZA Les Bougeries ; ▪ PPF118 : long de 40 m (± 50 cm), au niveau du boisement au nord de la ZA Les Bougeries ; ▪ PPF121 : long de 39 m (± 50 cm), au niveau du boisement au sud de la ZA de Mésinges ; ▪ PPF153 : long de 63 m (± 50 cm), au sud-ouest du viaduc du Pamphiot. 2 passages inférieurs pour la petite faune, larges de 1 m et hauts de 1 m, sont mis en place selon les modalités suivantes : ◦ PPF30 : long de 45 m (± 50 cm), au niveau du boisement à l’ouest de la ZAE des Bracots ; ◦ PPF147 : long de 100 m (± 50 cm), au nord du lieu-dit de Dursilly. 1 passage inférieur pour la petite faune, large de 1,75 m et haut de 1,50 m, est mis en place selon les modalités suivantes : ◦ PPF28 : long de 38 m (± 50 cm), au niveau du boisement à l’ouest de la ZAE des Bracots. Pour les passages inférieurs pour la petite faune PPF115, PPF118 et PPF121, la longueur de franchissement intègre le franchissement des voies d’exploitation et des clôtures faune. 5 passages avec fonction hydraulique sont mis en place selon les modalités suivantes : ◦ POH34 : haut de 1,90m, 1,90 m de large et long de 58 m (± 50 cm), au niveau du boisement au nord de la ZAE des Bracots – rétablissement BVN ; ◦ hauteur de 1,50 m, largeur de 1,90 m : ▪ POH64 : long de 40 m (± 50 cm), au niveau du boisement au nord de Bons-en-Chablais ; ◦ hauteur de 1,50 m, largeur de 1,50 m : ▪ POH45 : long de 73 m (± 50 cm), au niveau du boisement et de la zone humide au nord de « Loyer » ; ▪ POH109 : long de 68 m (± 50 cm), au niveau du boisement au nord de la ZA Les Bougeries ; ▪ POH141 : long de 43 m (± 50 cm), au nord du Jardin des copains ; ◦ pour l’ensemble de ces ouvrages, 2 banquettes de 0,50 m de large à Q10 en rive gauche et droite sont mises en place avec 0,75 m de tirant d’air au-dessus. 74 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 77
7 ouvrages hydrauliques sont mis en place selon les modalités suivantes : ◦ OH37 : un ouvrage de 5 m de large, long de 31 m (± 50 cm) et haut de 2 m est créé au niveau du ruisseau du Grand Vire ; ◦ OH75 : un ouvrage de 3,75 m de large, long de 56 m (± 50 cm) et haut de 1,50 m est créé au niveau du ruisseau de la Creuse ; ◦ OH97, OH97b et OH97c : des ouvrages de 5,50 m de large, respectivement long de 38 m, 46 m et 32 m (± 50 cm) et haut de 1,50 m sont créés au niveau du ruisseau du Gurnaz ; ◦ OH99 et OH99b : des ouvrages de 3 m de large, respectivement long de 67 m et 29 m (± 50 cm) et haut de 1,75 m est créé au niveau de l’affluent du Gurnaz ; ◦ les OH37, OH75, OH97, OH97b et OH97c sont aménagés avec 2 banquettes de 0,50 m de large à Q10 en rive gauche et droite, avec 0,70 m de tirant d’air au dessus ; ◦ les OH99 et OH99b sont aménagés avec une banquette de 0,50 m de large à Q10 en rive gauche et droite, avec 0,70 m de tirant d’air au dessus. Les banquettes de franchissement sont aménagées en même temps que la conception des passages concernés selon les modalités suivantes : ◦ matériaux utilisés : béton rugueux, bois, matériaux naturels (terre battue stabilisée, gravier fin, sable compacté) avec température modérée et humidité préservée et stable ; ◦ la hauteur des banquettes est adaptée au niveau de l’eau, de manière à toujours être accessibles, y compris en période de hautes eaux ; ◦ des aménagements favorables à la petite faune (pierriers, amas de branchages etc.) sont mis en place au niveau des banquettes afin de servir de guidage et de d’abris ; ◦ sauf impossibilité technique, la réalisation complémentaire d’un puits de lumière médian y est également intégrée. Un passage inférieur à double fonctionnalité passage à faune et agricole (PI148) de 7 m de large, long de 33 m (± 50 cm) et haut de 4,40 m est créé au niveau du chemin de Lauzenettaz. L’ensemble des passages petite et moyenne faune sont constitués de substrat meuble naturel et sont connectés aux haies et ripisylves. Les ouvrages sont créés de sorte à ce que le piégeage des individus soit impossible (sans ouverture, fentes, joints ou trous). Des clôtures de guidage sont installées de part et d’autre de tous les passages petite et moyenne faune avant la mise en service de l’autoroute, selon les caractéristiques techniques suivantes : ◦ longueur de guidage : 50 m de chaque côté du passage ; ◦ hauteur : de 60 cm à 1 m ; ◦ clôture principale avec treillis microfaune ; ◦ maille fine : 6,5 x 6,5 mm ; ◦ la partie basse du treillis est repliée vers l’intérieur afin d’empêcher le creusement ; ◦ une surépaisseur végétalisée est ajoutée le cas échéant selon l’avis de l’écologue, afin de créer un effet de couloir guidé. • Chiroptéroducs (MR6.c) : 11 chiroptéroducs de type « câble et boules » sont installés le long du tracé de l’autoroute en bordure de boisement et positionnés sur les couloirs principaux de routes de vol identifiés, comme localisé en annexe 24. Le dispositif repose sur 2 poteaux principaux implantés de part et d’autre de la chaussée et stabilisés par 3 câbles haubanés ancrés au sol. En partie supérieure, ces câbles sont horizontaux, parallèles et espacés verticalement de 50 cm. Chaque câble est équipé de boules blanches irrégulières disposées tous les 2 m, dont la texture renforce le retour d’écho pour l’écholocation. Elles sont positionnées en quinconce d’un câble à l’autre afin de renforcer la perception acoustique et visuelle de l’ensemble. Aucun éclairage n’est mis en place à proximité des chiroptéroducs. 75 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 78
Des aménagements végétalisés sont mis en œuvre afin d’assurer un guidage progressif des individus vers tous les dispositifs de franchissement (passages supérieurs, passages hydrauliques, chiroptéroducs) selon les modalités suivantes : ◦ plantation de haies denses et continues d’une largeur minimale de 2 m composées d’arbustes et d’essences arborées locales plurispécifiques (Charme, Érable champêtre, Aubépine, Prunellier, Noisetier, Chêne, etc.) en surplomb ou à proximité des ouvrages ; ◦ plantation de bosquets composés d’arbustes et d’essences arborées locales à croissance rapide (Merisier, Érable champêtre, Bouleau, etc.), sous forme de groupes suffisamment denses (1 à 2 plants par m²) ; ◦ proscrire l’utilisation d’engrais chimiques et de produits phytosanitaires ; ◦ mettre en défens les plants contre l’abroutissement, avec entretien des protections des années n à n+5 (n étant l’année de début des plantations) ; ◦ à partir de n+1 (n étant l’année de fin des travaux) et sur toute la durée de l’exploitation, l’entretien des haies et bosquets se fait par taille légère non systématique entre le 1er septembre et le 31 octobre. Les plantations de haies réalisées à ce titre totalisent un linéaire de 2 500 m, conformément aux dispositions du titre VII du présent arrêté. • Modalités de suivi : L’ensemble de ces aménagements et de leurs dispositifs de guidage font l’objet d’un entretien régulier. Un suivi de ces aménagements est réalisé en année n+1, n+2, n+3, n+4, n+5, n+10, n+15, n+20, n+25 et n+30 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements), il comprend : • suivi des apparitions de plantes invasives en parallèle des mesures d’entretien à raison de 2 passages par an minimum ; • suivi de l’évolution des zones ensemencées à raison de 3 passages par an minimum (mi-avril, juin, août / début septembre) ; • suivi de la fréquentation par pièges photographiques et observations nocturnes à raison d’un passage minimum aux périodes favorables ; • suivi des chiroptères par écoutes nocturnes à raison de 3 passages minimum répartis sur les mois de mai, juillet et septembre et vidéo thermique ou équivalent ; • suivi des reptiles par la mise en place de plaques relevées a minima une fois par mois en période favorable ; • suivi des insectes par prospections de terrain à raison de 3 passages minimum par an sur les milieux ouverts ; • suivi de la nidification à raison de 3 passages par an en mai, juillet, et automne (après chute des feuilles) ; • suivi des collisions sur l’autoroute par recueil de données trimestriel. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR7 : Installation d’abris ou de gîtes artificiels pour la faune • Avifaune (MR7.a) : Avant le démarrage des travaux, un minimum de 30 % des 244 nichoirs artificiels prévus sont mis en place en présence d’un écologue, comme localisé en annexe 26, selon les modalités suivantes : ◦ 40 nichoirs favorables aux Hirondelles disposés en groupe sur un même site ; ◦ 10 nichoirs favorables au Martinet noir intégrés aux murs des bâtiments ; ◦ 90 nichoirs favorables aux Mésanges ; ◦ 50 nichoirs favorables aux Moineaux ; ◦ 50 nichoirs favorables aux espèces semi-cavernicoles ; ◦ 2 nichoirs spécifiques à la Chouette hulotte ; ◦ 2 nichoirs spécifiques à la Chevêche d’Athéna ; 76 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 79
◦ les nichoirs sont installés avant le 1er mars, ou avant le 1er octobre pour les nichoirs spécifiques à la Chouette hulotte ; ◦ les nichoirs sont orientés est ou sud-est. Ils sont composés de béton de bois biosourcé ; ◦ les nichoirs font l’objet d’un entretien régulier pendant la phase chantier à raison de 2 passages chaque année entre avril et juillet ; ◦ à n+5, n+10 (n étant l’année de fin des travaux), puis tous les 10 ans jusqu’à n+30, les nichoirs font l’objet d’un entretien et sont remplacés le cas échéant. L’évolution de l’occupation des nichoirs fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5, n+10 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) à raison d’au moins 2 passages (avril-mai puis juin- juillet). Si ces suivis mettent en évidence l’absence d’occupation des nichoirs, ceux-ci sont déplacés sur des sites plus favorables, en concertation avec un écologue et au plus tard lors du passage suivant. • Amphibiens (MR7.b) : Avant le démarrage des travaux sur chaque secteur nouvellement impacté, tel que défini en annexe 27, des habitats favorables aux amphibiens sont recréés en présence d’un écologue à proximité de l’emprise du chantier, comme localisé en annexe 26, selon les modalités suivantes : ◦ réalisation de 2 mares permanentes d’environ 200 m² chacune par creusement. L’étanchéification est réalisée à l’aide d’argile ou de matériaux avec une faible perméabilité. Une plantation de végétaux aquatiques est réalisée et un ourlet herbacé périphérique est maintenu ; ◦ 5 mares temporaires d’environ 150 m² chacune par terrassement peu profond sur sol imperméable ou compacté. Un ensemencement léger de plantes hygrophiles est réalisé ; ◦ 12 ornières humides d’environ 100 m² chacune par creusement manuel ou avec engins, de fossés ou rigoles en zone boisée. L’étanchéification est naturelle ou favorisée par le tassement du sol ; ◦ des pentes inférieures à 30 % sont réalisées sur l’ensemble des sites afin de faciliter l’accès aux amphibiens et de limiter les risques de piégeage ; ◦ la réalisation de ces aménagements s’effectue à l’automne ; ◦ la localisation précise des sites est définie par l’écologue en charge du suivi du chantier et validée par la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement- durable.gouv.fr). Des zones refuges sont mises en place en présence d’un écologue à proximité des sites aquatiques recréés selon les modalités suivantes : ◦ abris en bois morts et branchages : empilements libres ou stabilisés de tas de bois morts et de troncs creux en lisière boisée ou proche de haies ; ◦ tas de pierres sur terrains bien drainés proches de haies ou de boisements ; ◦ buttes terreuses végétalisées : micro-reliefs peu élevés orientés sud avec ourlets herbacés à proximité immédiate des mares temporaires ; ◦ implantation de souches enterrées et semi-enterrées en bordure de boisement et à proximité de corridors écologiques ; ◦ conservation de zones de lisières forestières à proximité des sites recréés ; ◦ implantation d’au moins une structure hivernale à moins de 100 m de chaque site aquatique recréé ; ◦ regroupement de plusieurs types de refuge afin d’offrir une diversité de micro-habitats ; ◦ les matériaux utilisés sont naturels et pris sur site ; ◦ les zones sujettes aux inondations sont évitées pour l’implantation de ces structures. L’évolution de la fréquentation des mares fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) à raison de 3 passages par an minimum en période de reproduction (mars à juin) comprenant des inventaires visuels, des écoutes, des comptages de pontes et des relevés d’habitats. 77 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 80
L’évolution de la végétation et de la qualité hydrobiologique des mares fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) à raison d’au moins 1 passage par an concentré sur les espèces cibles et l’évolution morphologique des sites. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. • Mammifères terrestres (MR7.c) : Des habitats de substitution favorables au Muscardin et au Hérisson d’Europe sont mis en place en présence d’un écologue avant les travaux de déboisement sur chaque secteur nouvellement impacté, tel que défini en annexe 27, selon les modalités suivantes : ◦ a minima 105 nichoirs favorables au Muscardin sont mis en place à proximité immédiate des milieux favorables détruits au sein des zones favorables identifiées, soit 35 nichoirs dans les boisements situés sur les communes de Perrignier, Brenthonne et Lully ; ◦ a minima 200 refuges favorables au Hérisson d’Europe sont mis en place à partir des déchets des travaux de déboisement du chantier ; ◦ leur localisation indicative est précisée en annexe 26. L’évolution de l’occupation des refuges et nichoirs fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) à raison d’au moins 1 passage en période de reproduction. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. • Chiroptères (MR7.d) : Un minimum de 100 gîtes artificiels favorables aux chiroptères est implanté en période hivernale en présence d’un écologue, comme localisé en annexe 26, à environ 4 m de hauteur. Différents types de gîtes sont utilisés en fonction des secteurs d’implantation. 5 gîtes artificiels supplémentaires sont implantés à proximité de l’emprise des travaux de suppression des PN65 et 66. Les gîtes utilisés sont de préférence des gîtes auto-nettoyants. A défaut, ils font l’objet d’un nettoyage aussi souvent que nécessaire (sans produit de nettoyage) entre mi-septembre et mi-octobre pendant toute la durée du suivi. L’évolution de l’occupation des gîtes fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5, n+10, n+15, n+20, n+25 et n+30 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) à raison d’au moins 1 passage en dehors des périodes sensibles (reproduction et hibernation). Si ces suivis mettent en évidence l’absence d’occupation des gîtes, ceux-ci sont déplacés sur des sites plus favorables, en concertation avec l’écologue et au plus tard lors du passage suivant. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. • Reptiles (MR7.e) : A minima, 6 hibernacula sont créés avant le démarrage des travaux sur chaque secteur nouvellement impacté, tel que défini en annexe 27, en présence d’un écologue, tel que localisé en annexe 26. Chaque hibernaculum est aménagé sur un emplacement ensoleillé dans un trou d’environ 60 cm de profondeur, selon les modalités suivantes : ◦ creusement d’une fosse de 2 à 3 m de diamètre ; 78 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 81
◦ comblement du fond de la fosse par des matériaux de granulométrie 100 / 200 mm sur une épaisseur de 50 cm ; ◦ comblement avec un mélange de débris végétaux et de blocs minéraux jusqu’à une hauteur de 1 m au-dessus du terrain naturel ; ◦ apport de terre végétale sur une épaisseur minimale de 15 cm afin de constituer une couche enherbée et maintien d’un pierrier sommital ; ◦ aucune utilisation de mortier ; ◦ mise en place d’une signalisation adaptée pour éviter toute destruction. 2 hibernacula supplémentaires sont implantés à proximité de l’emprise des travaux de suppression des PN65 et 66. L’évolution de la fréquentation des hibernacula par les reptiles fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) à raison d’au moins 1 passage avant la période sensible. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. • Zones de frai (MR7.f) : A minima une fosse est créée au sein des tronçons de rescindement de 4 cours d’eau (ruisseau du Bois Tuillier, Grand Vire, Foron, ruisseau des Vernes), tel que localisé en annexe 26, afin de produire des conditions favorables au frai des poissons. Chaque fosse est aménagée selon les modalités suivantes : ◦ utilisation de substrats favorables aux espèces cibles : galets / graviers pour la Truite fario, blocs / sous-berges pour le Chabot ; ◦ creusement de fosses de 50 cm de profondeur maximum. Les fosses créées font l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de mise en œuvre des aménagements) en période de frai des espèces cibles, en lien avec la Fédération de pêche. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR8 : Adaptation écologique des pratiques de fauchage • En phase travaux (MR8.a) : Une fauche adaptée est mise en place au sein des emprises chantier, comme localisé en annexe 23, selon les modalités suivantes : ◦ fauchage par bandes ou fauchage centrifuge du centre vers l’extérieur tel que représenté sur le schéma ci-après afin de permettre la fuite des individus ; ◦ la vitesse d’avancement n’excède pas les 10 km/h ; ◦ des espaces de végétation non fauchés sont maintenus afin de maintenir des zones refuges ; ◦ la fauche de nuit est proscrite, sauf urgence relative à un danger pour les biens ou les personnes ; ◦ une seule machine par zone de fauche . 79 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 82
En cas d’observation d’individus, les travaux de fauche sont stoppés immédiatement jusqu’au départ spontané des individus. • Pratique de gestion différenciée en exploitation (MR8.b) : Une gestion différenciée des milieux ouverts est mise en œuvre au sein des dépendances vertes de l’infrastructure (accotements, talus), selon les modalités suivantes : ◦ fauchage tardif à partir du 15 juillet sur l’ensemble des milieux ouverts au sein de la zone projet ainsi que ceux présentant un intérêt écologique (lisières, clairières, friches) dans les zones tampons autour du projet ; ◦ des zones d’exclusion sont mises en place 3 m après la bande d’arrêt d’urgence et 3 m en pied de clôture ; ◦ la hauteur de fauchage est supérieure à 10 cm ; ◦ fauchage par bandes alternées dans le temps et l’espace pour maintenir des refuges permanents. La diversité floristique et entomologique de ces espaces fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de mise en service de l’infrastructure) sur transects fixes en suivant le protocole Pollinisateurs. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR9 : Mesures spécifiques aux amphibiens • Mise en place de dispositifs anti-intrusion amphibiens (MR9.a) : Un dispositif de non-intrusion de la petite faune est mis en place sur la section des travaux situés au droit des secteurs les plus sensibles, comme localisé en annexe 28, sur un linéaire total de 19 km environ, afin de permettre aux espèces de quitter le périmètre opérationnel et d’empêcher leur retour. Le dispositif est composé d’une clôture doublée d’un filet ou treillis à maille serrée (5 mm sur la partie basse) ou d’une bâche ou géotextile d’une hauteur minimale de 50 cm et enfoncée sur une profondeur d’environ 15 cm. Il est incliné (au moins pour partie) d’environ 30 à 45° en direction de l’extérieur du chantier. Des rampes de sortie peuvent être ajoutées. 80 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 83
Les dispositifs sont installés à l’avancement des travaux de déboisement et sont maintenus en état pendant toute la durée du chantier. Ces dispositifs sont installés sous contrôle de l’écologue en charge du suivi de chantier, avec entretien quotidien de février à juillet, et hebdomadaire le reste de l’année. • Défavorabilisation des emprises travaux et pêche de sauvegarde in situ (MR9.b) : En amont des travaux de déboisement et de fauche, les sites de reproduction potentiels des amphibiens, tel que localisés en annexe 28, sont examinés par un écologue à la recherche d’individus. En cas de contact avec des spécimens, ceux-ci sont capturés, selon les modalités du protocole POP Amphibiens, puis relâchés immédiatement à l’extérieur de l’emprise chantier, comme localisé de manière indicative en annexe 28, préférentiellement au niveau des habitats de substitution préalablement créés (voir MR7) et des sites de compensation de la mesure MC03. Les emprises travaux sont examinées tout au long du chantier, au moins une fois par semaine, afin d’identifier des micro-habitats créés et colonisés par les amphibiens. En période de reproduction (mars à juin), le nombre de passages est renforcé. Les ornières créées par les engins de chantier sont rebouchées sous un jour ouvré après la fin de l’intervention, sous contrôle d’un écologue qui assure une pêche de sauvegarde le cas échéant. Lors des opérations de sauvetage, un herpétologue opère un tri entre le Triton crêté ( Triturus cristatus) et le Triton crêté italien (Triturus carniflex), espèce exotique envahissante en France. Les individus de Triton crêté italien sont laissés sur place au sein des emprises travaux. Les captures sont réalisées selon des modalités et à l’aide de moyens n’occasionnant aucune blessure ni mutilation aux animaux capturés. Afin de limiter la dissémination de chytridiomycose et d’autres maladies (ranaviroses), les prescriptions du protocole d’hygiène pour le contrôle des maladies des amphibiens dans la nature à destination des opérateurs de terrain sont scrupuleusement respectées. MR10 : Mesures ciblées favorables aux Chiroptères • Installation de dispositifs anti-retour (MR10.a) : Avant le début des travaux d’abattage et de démolition, toutes les zones de gîtes potentiels au sein de l’emprise des travaux, localisées en annexe 23, font l’objet d’un diagnostic préalable par un chiroptérologue, par le biais d’une écoute en fin de journée ou début de nuit, et d’une inspection en hauteur à l’aide d’un endoscope. Un marquage visant à identifier ceux qui présentent potentiellement un enjeu pour la faune est réalisé. Des dispositifs anti-retour sont mis en place sur les points d’entrée des gîtes afin de permettre aux individus de sortir du gîte et d’empêcher leur retour avant de procéder à l’obstruction des fissures ou à l’enlèvement des éléments pouvant potentiellement servir de gîte transitoire. Dans le cas où l’abattage « doux » ne pourrait pas être réalisé (pour des raisons topographiques par exemple) : ◦ si constat de présence ou s’il est impossible de s’assurer de l’absence de spécimens, pose de dispositifs anti-retour et attente du départ spontané des individus avant de procéder à l’abattage ; ◦ si absence certaine de spécimens, obstruction immédiate de la cavité. 81 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 84
• Abattages protocolés des arbres favorables au gîte (MR10.b) : Pour les arbres présentant un enjeu pour la faune et marqué comme précisé supra, un dispositif particulier d’abattage (dit « doux ») est mis en place dans le respect de la période d’intervention de la MR1.a. Il s’appuie sur les étapes suivantes : abattage progressif par coupe des branches, puis du tronc. Si l’arbre ne peut pas être enlevé par tronçon, l’abattage est réalisé en amenant au sol l’arbre entier en douceur, au moyen d’un appareil de levage ou équivalent. Les différents éléments sont descendus en douceur (usage de cordes ou d’une nacelle) et déposés délicatement sur le sol et laissés sur place pendant au moins 48 heures. Ils peuvent ensuite être déplacés. Un chiroptérologue est présent sur le chantier pendant toute la durée de la mise en œuvre de cette mesure. Aucune action d’effarouchement n’est permise. Les comptes-rendus des expertises réalisées et la mise en œuvre des actions engagées pour chaque arbre et chaque ouvrage d’art sont restitués dans le rapport de suivi de la phase chantier décrit au niveau de la mesure MA09. Si des individus sont apparemment blessés, ils sont confiés à un centre de soin. MR11 : Mesures spécifiques pour le Castor d’Europe Des dispositifs de mise en défens sont installés au niveau des ripisylves de part et d’autre de la zone travaux, conformément à la mesure ME1. En complément, des mesures d’atténuation des nuisances sonores et lumineuse sont mises en place (voir MR3). Les conditions écologiques au sein des emprises du chantier sont rendues peu attractives pour le Castor d’Europe, selon les dispositions suivantes, en phase travaux : • débroussaillage régulier des repousses ligneuses ; • fauche de la strate herbacée pour éviter la reconstitution d’une ripisylve dense attractive pour l’espèce ; • évacuation des bois issus du déboisement hors emprises travaux. Les berges créées ou remaniées sont laissées en pente forte supérieure à 45° et dépourvues de végétation ligneuse. Avant travaux, un écologue s’assure de l’absence de terrier hutte au sein de l’emprise travaux. En cas de présence avérée d’un terrier hutte, les mesures suivantes sont mises en place : • mise en défens immédiate de la zone par une barrière physique visible avec interdiction d’accès aux engins et personnels ; • débroussaillage de la végétation environnante conformément aux prescriptions de la mesure MR1, avec export systématique des produits de coupe hors emprise travaux ; • dans un délai de 20 jours suivant la mise en défens, l’écologue procède à une inspection du terrier hutte : ◦ si constat de présence ou s’il est impossible de s’assurer de l’absence d’activité de l’espèce, l’arrêt des travaux est maintenu ; ◦ si absence certaine de spécimens, le terrier est démonté et évacué hors des emprises chantier et les entrées sont comblées ; • reprofilage de la berge en pente raide supérieure à 45° et débroussaillage régulier des repousses ligneuses. A minima, 2 habitats de substitution favorables à l’espèce sont mis en place sur les sections de cours d’eau créés tel que localisé en annexe 21, selon les modalités suivantes : • les berges des cours d’eau rescindés sont aménagées en alternance de pentes douces (entre 10 et 20°), favorables à l’accessibilité et au déplacement, et de talus plus raides (entre 45 et 60°), permettant le creusement et l’ancrage de terriers ; • maintien d’une profondeur d’eau minimale de 50 cm au pied de berge afin de garantir la possibilité d’entrées immergées ; • réalisation de micro-habitats favorables à l’espèce ; 82 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 85
• stabilisation des berges dès la phase chantier par des techniques de génie végétal ; • implantation d’une ripisylve pionnière à base de bois tendres (Salix alba, S. cinerea, Populus nigra, Alnus glutinosa) par boutures, plançons et jeunes plants, répartis en pied de berge et en haut de talus, avec un espacement de plantation de 1,5 à 2 m ; • mise en place d’une strate arbustive secondaire ; • mettre en défens les plants avec des protections des années n à n+5 (n étant l’année de début des plantations). MR12 : Mesures spécifiques aux Reptiles • Sauvetage avant destruction de spécimens – Lézard des murailles (MR12.a) : En amont des travaux de démolition de bâti, les sites favorables au Lézard des murailles, tel que localisés en annexe 28, sont examinés par un herpétologue à la recherche d’individus. En cas de contact avec des spécimens, 10 dispositifs d’accueil (briques creuses ou équivalent) par zone au minimum sont installés en vue du transport. Ces dispositifs sont relevés a minima 2 fois par semaine selon un protocole validé par l’herpétologue. L’herpétologue se charge ensuite de relâcher les individus capturés vers des milieux favorables hors emprise des travaux. • Défavorabilisation des emprises en phase chantier par gestion des stocks de matériaux (MR12.b) : Les stocks de matériaux sont compactés afin d’éviter la création de micro-habitats favorables aux reptiles. En complément, des habitats favorables sont créés hors emprise travaux, conformément à la mesure MR7. MR13 : Optimisation de la gestion des bois morts Les éléments présentant un enjeu pour la faune (arbres sénescents, troncs creux, souches etc.) situés hors emprises des travaux sont conservés et mis en défens par une barrière physique visible. Les rémanents (pierres, branchages) issus des emprises chantier sont réutilisés pour la création d’habitats favorables à la faune conformément à la MR7. MR14 : Déplacement d’individus d’espèces végétales protégées • Bryophytes (MR14.a) : Avant le démarrage des travaux, une actualisation des populations de bryophytes est réalisée par un écologue dans les milieux favorables à ces espèces, tel que localisés en annexe 22. Les supports (troncs, branches, souches) colonisés par des bryophytes font alors l’objet d’un prélèvement précautionneux (sans brossage ni raclage) en présence d’un écologue. Ils sont ensuite transférés vers des boisements hors emprise travaux disposant des mêmes conditions écologiques que les sites de prélèvement, préférentiellement au sein des zones de compensation du projet (voir MC02). La localisation précise des sites d’accueil est validée par un écologue. Le protocole de déplacement et de sauvetage des bryophytes saprolignicoles est présentée en annexe 29.a. Les protocoles expérimentaux de mise en culture et de réintroduction de la Buxbaumie verte et de translocation de colonies gamétophytiques sont décrits à la mesure MA11 et en annexe 29.b. 83 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 86
L’état de conservation de l’espèce fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5, n+10, n+15, n+20 (n étant l’année de transfert), à raison d’1 passage minimum par an, avec photographie géoréférencée. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. • Œillet superbe (MR14.b) : Avant le démarrage des travaux, une actualisation des stations d’Œillets superbes présentes dans l’emprise des travaux est réalisée par un écologue (annexe 22). Ces zones sont matérialisées par des balisages physiques visibles en période de floraison, soit du 1er juin au 1er septembre. Un écologue réalise a minima 1 passage tous les 10 jours pour identifier la période optimale de récolte de graines. Les graines, une fois arrivées à maturité, sont ensuite récoltées in situ à la main, séchées puis stockées avant leur mise en culture. Les plantations sont réalisées dans des sites favorables et préférentiellement au sein des zones de compensation du projet. En complément, des opérations de translocation des plants sont réalisées à l’automne avant le démarrage des travaux, selon les modalités suivantes : ◦ décapage et récupération des plants en rosettes avec motte de terre ; ◦ identification des plants et stockage de courte durée des matériaux in situ sur un secteur préalablement validé par l’écologue, exempt de toutes espèces exotiques envahissantes ; ◦ replantation dans la même journée des stations sur le site d’accueil ; ◦ mise en défens du site d’accueil à l’aide d’une barrière physique visible ; ◦ entretien des plants pendant les années n à n+3 (n étant l’année de plantation). Le protocole de transplantation des plants est indiqué en annexe 30. La localisation précise des sites d’accueil est définie par l’écologue en charge du suivi du chantier en lien avec ASTERS-CEN74, qui accompagne le bénéficiaire pour la mise en œuvre de cette mesure, et validée par la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). L’état de conservation de l’espèce sur les sites d’implantation fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5, n+10, n+15, n+20 (n étant l’année de transfert), à raison d’1 passage minimum par an. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. • Ail rocambole (MR14.c) : Avant le démarrage des travaux, une actualisation des stations d’Ail rocambole présentes dans l’emprise des travaux est réalisée par un écologue (annexe 22). Ces zones sont matérialisées par des balisages physiques visibles en période de floraison, soit du 1er juin au 1er septembre. Une fois les bulbes arrivés à maturité, un écologue se charge de les récolter selon les modalités suivantes : ◦ prélèvement des bulbes avec précaution à l’aide d’une fourche-bêche en conservant le système racinaire et une motte de terre autour du collet ; ◦ stockage des plants in situ sur un secteur préalablement validé par l’écologue, exempt de toutes espèces exotiques envahissantes. Des opérations de translocation sont réalisées immédiatement après le prélèvement, et avant le démarrage des travaux, selon les modalités suivantes : ◦ plantation des bulbes sur le site d’accueil dans des poches de sol ameubli, espacés de 10 cm afin d’éviter leur concurrence ; 84 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 87
◦ butter ou pailler afin de protéger les bulbes ; ◦ mise en défens du site d’accueil à l’aide d’une barrière physique visible ; ◦ entretien des plants pendant les années n à n+3 (n étant l’année de plantation). La localisation précise des sites d’accueil est définie par l’écologue en charge du suivi du chantier en lien avec ASTERS-CEN74, qui accompagne le bénéficiaire pour la mise en œuvre de cette mesure, et validée par la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). L’état de conservation de l’espèce fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5, n+10, n+15, n+20 (n étant l’année de transfert), à raison d’1 passage minimum par an. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR15 : Gestion des espèces végétales exotiques envahissantes Se référer aux prescriptions générales sur le sujet (article 20.1). Cette mesure est localisée en annexe 22. MR16 : Pêches de sauvegarde des poissons Se référer aux prescriptions générales sur le sujet (article 24.2). Cette mesure est localisée en annexe 21. MR17 : Gestion des sols sur les zones de travaux restituées Avant toute installation de zones de travaux temporaires, un décapage des sols est réalisé par séparation des horizons. Les horizons sont ensuite stockés séparément sous forme d’andains clairement identifiés, dont la hauteur est inférieure à 3 m. Les aires de stockage sont localisées sur des substrats stables et drainants, hors zones humides et hors foyers d’espèces exotiques envahissantes. En cas de stockage prolongé, un couvert végétal, constitué d’espèces à croissance rapide issues de la marque « Végétal local » ou équivalent, est semé rapidement et entretenu par fauche avec export. La circulation des engins dans les zones travaux est limitée à des trajets matérialisés et planifiés afin d’éviter un trafic diffus sur les sols décapés ou les andains. En conditions humides, lorsque que le risque de tassement profond est accru (ornières, stagnation d’eau, phénomènes de pompage), des dispositifs de protection ponctuels (géotextiles, renforcement de structures de pistes de chantier) sont déployés au droit des zones de forte sollicitation. En fin de chantier, les horizons sont replacés dans leur ordre naturel. La repose est réalisée par couches régulières, nivelées avec soin, sans compactage mécanique agressif. Le tassement ultérieur est laissé au processus naturel. Les sols remis en place sont ensemencés dès que possible en période favorable à la repousse avec des mélanges prairiaux locaux adaptés. Sur les talus et pentes sensibles, des protections complémentaires (paillage, toiles coco) sont mises en place afin de limiter l’érosion. Une vigilance particulière est menée pour la lutte contre les espèces exotiques envahissantes, conformément à la mesure MR15. La reprise de la végétation fait l’objet d’un suivi après travaux en année n+1, n+2 et n+3 (n étant l’année de fin des travaux). Des mesures correctives sont proposées le cas échéant. 85 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 88
L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR18 : Remise en état des emprises travaux temporaires après chantier Les milieux utilisés temporairement en phase travaux, localisés en accord avec leurs propriétaires, font l’objet d’une restauration après chantier. Les milieux sont restitués à l’état initial existant avant travaux. Certaines parcelles peuvent être restituées exceptionnellement selon leur usage et vocation, en concertation avec les propriétaires fonciers concernés, le cas échéant avec les exploitants des terrain, et après validation de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). Cette restitution est achevée au plus tard au 6 mois après la mise en service. Pour les zones prairiales à restituer, la couche superficielle de terres est décapée et stockée dans des conditions favorables au maintien de la banque de graines. Elle est ensuite régalée de façon à favoriser la recolonisation végétale par les espèces présentes dès l’achèvement des travaux. En complément, un épandage des produits de fauche est réalisé en tant que de besoin. Pour les espèces ligneuses, les essences plantées sont adaptées aux conditions édaphiques locales ; il s’agit exclusivement d’espèces autochtones sauvages (excluant toute variété ornementale), labellisées « Végétal local » ou équivalent. Toutes les espèces choisies pour être semées ou plantées font l’objet d’une validation par l’écologue et d’une surveillance régulière et sont remplacées autant de fois que nécessaire au cours des cinq années suivant l’année de démarrage des plantations pour assurer une densité et une diversité suffisantes à la recréation des milieux écologiques visés. Les sites restaurés font l’objet d’un suivi après travaux en année n+1, n+2 et n+3 (n étant l’année de fin des travaux) afin de qualifier la réussite de recolonisation des milieux par les espèces. Des mesures correctives sont proposées le cas échéant. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR19 : Défavorabilisation des bassins de rétention Immédiatement après la création des bassins de rétention, des barrières anti-intrusion à petites mailles sont mises en place autour des bassins créés et localisés en annexe 28, et entretenues tout au long de ceux-ci. Des rampes de sortie sont installées afin de faciliter la fuite des individus qui auraient réussi à franchir les barrières. Une fauche régulière autour des bassins est mise en place conformément à la mesure MR1. La végétation aux abords immédiats des bassins est retirée. Avant chaque entretien des bassins, un passage d’écologue est réalisé : • si constat de présence d’espèces protégées, les interventions ont lieu hors des périodes sensibles. Les individus sont déplacés hors emprise travaux le cas échéant ; • si absence certaine de spécimens, les opérations d’entretien sont réalisées. MR20 : Mesures spécifiques pour le Cuivré des marais Avant le démarrage des travaux, un écologue procède à une actualisation de la localisation des stations de plantes hôtes du Cuivré des marais au sein de l’emprise travaux. 86 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 89
Des opérations de translocation sont réalisées immédiatement après le prélèvement sur des sites d’accueil préalablement identifiés par un écologue et validés par la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr), selon les modalités suivantes : • isolement des plants à l’aide de filets à petite maille ; • prélèvement des plants et transferts vers le site d’accueil ; • replantation des plants sur le site d’accueil. Les secteurs de surveillance renforcé pour cette espèce sont localisés en annexe 22. Les plantes hôtes transplantées font l’objet d’un suivi hebdomadaire jusqu’à la fin de la deuxième génération du Cuivré des marais. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MR65 – Mesures spécifiques au Carabe noduleux Avant le démarrage des travaux en cours d’eau sur les ruisseaux d’Avully, du Pamphiot, du Redon, des Communs, de la Gorge, de la Creuse et du Foron, un diagnostic préalable des berges est réalisé par un écologue à la recherche d’individus. En cas de contact avec des spécimens, ceux-ci sont capturés puis relâchés immédiatement à l’extérieur de l’emprise chantier, comme localisé de manière indicative en annexe 31. Les emprises travaux font l’objet de contrôles réguliers par l’écologue tout au long des travaux en cours d’eau. Les modalités suivantes sont mises en place sur l’ensemble des cours d’eau, à l’exception du ruisseau du Pamphiot : • abattage réalisé en présence d’un écologue avec de petits moyens mécaniques adaptés et travaux déportés dans un rayon de 10 m de chaque côté du cours d’eau ; • conservation d’un corridor non dessouché de 10 m de part et d’autre des cours d’eau. Les souches sont conservées en place y compris au niveau de chaque piste de franchissement temporaire de cours d’eau ; • mise en place d’une piste temporaire adaptée au droit des berges des franchissements provisoires sur géotextile renforcé et utilisation de cailloux pour créer la piste. À la fin des travaux en cours d’eau, les milieux font l’objet d’une remise en état selon les modalités suivantes : • les troncs jugés d’intérêt par l’écologue, stockés pendant les travaux, sont réutilisés au niveau des abords des cours d’eau afin de reconstituer des micro-habitats favorables au Carabe noduleux ; • les pistes provisoires sont retirées ; • des plantations d’essences arbustives hautes d’origine indigène sont effectuées assurant ainsi une continuité du couvert végétal de part et d’autre des ouvrages. Mesures spécifiques au niveau des ruisseaux d’Avully et du Redon : • le franchissement provisoire sur le ruisseau du Redon est mis en place via un pont afin de limiter l’impact sur les berges et le cours d’eau ; • les zones boisées non dessouchées font l’objet d’une remise en état par régénération naturelle accompagnée de plantation le cas échéant. Seul un linéaire de 70 m maximum sur les deux ruisseaux d’Avully, situé sous l’axe de l’autoroute demeure en végétation arbustive du fait de la hauteur sous tablier. 87 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 90
Mesures spécifiques au niveau des ruisseaux du Foron, de la Creuse et des Communs : • un décapage préalable des horizons de sol superficiels est effectué par des moyens mécaniques adaptés. Ce sol est stocké en petits merlons et mis en défens à l’aide d’une barrière physique visible jusqu’à sa remise en état au niveau des berges des cours d’eau rétablis. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. ARTICLE 30.3 Mesures de compensation Le bénéficiaire, ou ses mandataires, met en œuvre les mesures de compensation ci-dessous, localisées à titre indicatif en annexe 4. Pour chaque site, un plan de gestion est transmis à la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal- ara@developpement-durable.gouv.fr) dans un délai de 8 mois suivant la délivrance de la présente autorisation. Ce document comprend a minima l’état initial complet, les objectifs écologiques, les modalités techniques, le calendrier, les indicateurs de résultats, les seuils d’alerte, les modalités de gestion adaptative et les engagements fonciers du site. Pour les milieux prairiaux, il précise les conditions de gestion et d’exploitation notamment à partir des volumes et quantité de fertilisation à utiliser, des molécules autorisées, et des conditions de traitement des troupeaux en cas de charge parasitaire. Pour toutes les mesures, les espèces ligneuses plantées et mélanges de graines sont composées exclusivement d’espèces autochtones adaptées aux conditions édaphiques locales. Les sujets ligneux font l’objet d’une surveillance régulière et sont remplacés autant de fois que nécessaire au cours des cinq premières années suivant les plantations. Aucun produit phytosanitaire n’est utilisé sur les zones de compensation, sans préjudice des dispositions suivantes. La DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) est tenue informée sans délai de toutes les démarches mises en œuvre afin de garantir la pérennité des mesures compensatoires, en particulier en cas de renouvellement ou de modifications des contractualisations. La gestion technique des mesures compensatoires peut être confiée à un opérateur spécialisé compétent en écologie. Dans ce cas, la charge financière et la responsabilité administrative liées à la mise en œuvre des mesures restent à la charge du bénéficiaire durant toute la durée de l’engagement. La gestion technique est alors effectuée dans le respect des dispositions du présent arrêté. Dans ce cas, la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) est informée sans délai de l’opérateur spécialisé retenu via la fourniture des conventions associées et de tout changement intervenant ensuite au cours de la durée de l’engagement. La liste des mesures compensatoires réalisées par site de compensation est précisée en annexe 4. La cartographie des mesures compensatoires au sein des sites est présentée en annexe 4. Les mesures de compensation sont réalisées avec l’accompagnement d’un écologue. Des actions correctives adaptées sont mises en œuvre sans délai en cas d’inefficience, notamment mise en évidence lors des suivis. MC01 - Milieux prairiaux ou fourrés • MC01.1 – Aménagement de gestion de prairies : Des pratiques de gestion favorables à la biodiversité sont mises en place au niveau des prairies dégradées des sites compensatoires. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : 88 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 91
◦ ALLI_01 : 1,3 ha ; ◦ NERN_02_05 : 20,31 ha ; ◦ CHENS_09 : 19,04 ha. Les mesures de restauration sont mises en œuvre selon les modalités suivantes : ◦ le désherbage chimique est proscrit à l’exception des traitements localisés visant à lutter contre les espèces exotiques envahissantes conformément aux arrêtés préfectoraux en vigueur (Ambroisies, Chardon des champs). Cette exception ne s’applique pas dans la bande de 5 m autour des mares et haies ; ◦ un sur-semis sans labour peut être mis en place afin de renouveler le couvert végétal, sous réserve de validation de l’écologue en charge du suivi des mesures compensatoires ; ◦ une fertilisation par apport de fumure ou de fertilisants minéraux et organiques est possible tous les 2 ans dans la limite maximale de 30 unités d’azote/ha/an sous réserve de validation de l’écologue en charge du suivi des mesures compensatoires. La fertilisation est proscrite sur les bandes tampon et à moins de 5 m des bordures des mares et haies. Gestion par pâturage : La pression de pâturage est limitée à 1 Unité de Gros Bétail (UGB) par hectare et à 0,8 UGB/ha au sein des prairies humides. Le pâturage est autorisé du 1er avril au 15 octobre. Une fauche estivale des refus avec exportation obligatoire du fourrage est possible du 15 juillet au 15 octobre en concertation avec l’écologue en charge du suivi des mesures compensatoires. Ces dispositions peuvent être adaptées après concertation avec l’écologue en charge du suivi des mesures compensatoires et validation de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal- ara@developpement-durable.gouv.fr). Les animaux adultes traités n’ont pas accès aux parcelles pendant au moins 15 jours. Des aménagements de protection des milieux naturels (clôtures de mises en défens de cours d’eau, boisements, mares, etc.) sont mis en place et font l’objet d’un entretien régulier. Gestion par fauche : Une fauche annuelle tardive avec exportation des résidus de fauche est réalisée à partir du 15 juillet. La fauche est réalisée de manière centrifuge à une hauteur de 10 cm et à une vitesse inférieure à 10 Km/h. Les résidus de fauche sont exportés. Une bande enherbée de 10 m de large est maintenue en pied de haie. Un broyage de la bande est effectué après le 15 septembre. • MC01.2 – Conversion d’une culture/prairie améliorée en prairie permanente : Les cultures ou prairies améliorées des sites compensatoires sont converties en prairie permanente, selon les modalités suivantes : ◦ déchaumage ou labour si culture non fourragère ; ◦ préparation du lit de semence à la herse rotative puis roulage si céréales à paille ; ◦ semis d’un couvert herbacé. Les semences sont issues de la marque « Végétal local » ou équivalent ; ◦ réalisation d’un roulage, voire 2 après concertation de l’écologue en charge du suivi des mesures compensatoires. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ ALLI_03 : 0,11 ha ; ◦ NERN_02_03 : 8,34 ha ; ◦ BALL_14 : 7,72 ha ; ◦ CHENS_09 : 4,74 ha. L’entretien est ensuite réalisé selon les modalités techniques présentées dans le cadre de la MC01.1. 89 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 92
• MC01.3 – Restauration de mégaphorbiaie : Les prairies humides abandonnées font l’objet d’une réouverture des milieux selon les modalités suivantes : ◦ coupe et évacuation des ligneux économiquement valorisables avec exportation des rémanents d’exploitation et rognage éventuel des souches des gros sujets ; ◦ débroussaillage manuel avec préservation de 5 à 10 ligneux par hectare ; ◦ évacuation des rémanents de coupe en veillant à la préservation des sols. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ ALLI_01 : 3,2 ha ; ◦ ALLI_03 : 5 ha ; ◦ LULLY_04 : 0,6 ha ; ◦ LULLY_07 : 0,21 ha. Les milieux restaurés sont gérés de façon extensive selon les modalités techniques présentées dans le cadre de la MC01.1. • MC01.4 – Création et restauration de fourrés : Des fourrés sont créés par plantation d’espèces indigènes issues de la marque « Végétal local » ou équivalent. La plantation est réalisée par bouquets denses sur les surfaces à végétaliser. Les plants sont remplacés autant de fois que nécessaire au cours des 5 années suivant l’année de démarrage des plantations. Les fourrés en cours de fermeture font l’objet de travaux d’abattage ciblé des arbres accompagnés d’un débroussaillage sélectif entre le 1er septembre et le 28 février en présence d’un écologue. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes :: ◦ ALLI_01 : 3,23 ha ; ◦ NERN_02_05 : 1,93 ha ; ◦ LULLY_02 : 0,11 ha ; ◦ LULLY_07 : 0,42 ha ; ◦ BONS_09 : 0,15 ha. Un entretien est réalisé tous les 3 ans afin d’éviter la repousse des ligneux. • MC01.5 – Réouverture de milieux : Des opérations d’ouverture de végétation sont réalisées du 1er septembre au 28 février après passage d’un écologue. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ ALLI_01 : 12,8 ha ; ◦ ALLI_03 : 6,71 ha ; ◦ LULLY_04 : 0,94 ha. Des andains périmétraux sont réalisés à partir des résidus de coupe favorisant l’accueil des reptiles au sein des milieux restaurés. MC02 – Milieux boisés Pour les sites de Bons-en-Chablais, Allinges et Loisin, les mesures compensatoires en milieu forestier sont mises en œuvre conformément aux adaptations techniques demandées par l’ONF et précisées dans les plans de gestion à venir : • à Bons-en-Chablais, la variante technique V2 est retenue, comprenant une diversification accélérée des boisements feuillus et la constitution d’une trame de vieux bois ou d’îlots de sénescence représentant 15 % de la surface du site ; 90 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 93
• à Allinges, la mesure est adaptée afin de permettre une conversion partielle du boisement, avec conservation d’une partie du peuplement et évolution vers un boisement hygrophile plus résilient ; • à Loisin, la mesure est requalifiée en diversification de boisement. Les modalités de mise en œuvre de ces mesures respectent les règles techniques applicables aux forêts relevant du régime forestier. • MC02.1 – Plantation de milieux boisés : Des plantations de boisements diversifiés sont réalisées au sein des prairies mésophiles temporaires des sites compensatoires selon les modalités suivantes : ◦ appliquer les densités de plantation de l’ordre de 2000 à 2200 tiges/ha en quinconce, selon le schéma suivant ; ◦ essence objectif 80 % : Quercus petraea ; ◦ essences de diversification en bouquet 20 % : Sorbus torminalis, Prunus avium, Pyrus cordata, Pinus sylvestris ; ◦ création de cloisonnement de 4 m avec une ligne toutes les 6 plantées et cloisonnements transversaux ; ◦ mise en place de protections individuelles et de paillis ou dalles biodégradables. Un entretien est réalisé à raison d’un passage par an en septembre par broyage des graminées autour des plants et sur les interlignes, sur les 3 premières années puis tous les 3 ans à 5 ans pendant 10 ans. Le cas échéant, un entretien manuel est réalisé au sein des gaines de protection. Les repousses feuillues sont conservées afin de protéger les plants du gibier. Un marquage de 100 à 400 arbres par hectare est réalisé dès qu’ils atteignent entre 8 et 12 m de hauteur. Dès la fermeture du couvert forestier, une première coupe d’éclaircie est réalisée entre le 1er septembre et le 28 février en prélevant 25 à 40 % des tiges. Des éclaircies supplémentaires sont réalisées tous les 5 à 15 ans selon la densité et la qualité du peuplement. Une végétation de lisière est conservée le long des cloisonnements. 91 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 94
Une récolte est réalisée dès lors que les arbres atteignent une circonférence entre 150 et 180 cm. Un réseau d’arbres sénescents est maintenu de l’ordre de 5 à 10% des tiges à terme en plus des îlots de bouquets d’essences de diversification. Les arbres morts ou en mauvais état sanitaire ne sont abattus qu’en cas de danger pour les biens ou les personnes, et laissés sur place après bûcheronnage. Aucun entretien du sous-bois n’est réalisé. • MC02.2 et MC02.2 bis – Mise en place d’îlots de sénescence et d’îlots de sénescence partiels : ◦ Mise en place d’îlots de sénescence Une gestion des boisements par libre évolution est mise en œuvre sans limite de durée afin de favoriser la diversification des habitats forestiers et des sous-strates arbustives et herbacées. Les arbres morts ou en mauvais état sanitaire à proximité des voies de communication (routes, chemins etc.) ne sont abattus qu’en cas de danger pour les biens ou les personnes, et laissés sur place après bûcheronnage. ◦ Mise en place d’îlots de sénescence partiels Des îlots de 0,5 ha a minima sont gérés en libre évolution au sein de boisements matures exploités en sylviculture afin de favoriser la biodiversité liée au vieux bois. Ces îlots sont répartis de sorte à représenter 15 % de la surface totale du site et sont localisés à distance des zones fréquentées (sentier de randonnées, etc.). Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ ALLI_01 : 37,83 ha ; ◦ ALLI_03 : 4,51 ha et 7,73 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ BONS_09 : 9,01 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ LOIS_18 : 7,46 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ NERN_02_05 : 14,97 ha ; ◦ LULLY_02 : 0,8 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ LULLY_03 : 4,45 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ LULLY_04 : 6,25 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ LULLY_07 : 6,19 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ SCIEZ_06 : 19,59 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ CHENS_07 : 6,18 ha (îlots de sénescence partiels) ; ◦ CHENS_09 : 4,16 ha. • MC02.3 – Diversification du boisement : Un itinéraire d’enrichissement par plantation au sein de trouées créées est réalisé au sein des parcelles boisées présentant une faible richesse spécifique selon les modalités suivantes : ◦ création de trouées par ouvertures progressives et localisées (prélèvement maximum de 20 % des tiges à chaque opération). Les coupes sont réalisées à intervalles réguliers compris entre 7 et 10 ans ; ◦ implantation d’essences diversifiées indigènes et locales d’arbres et d’arbustes en bouquet, adaptées à la station forestière. Des extractions peuvent avoir lieu entre le 1er septembre et le 28 février par débardage à cheval ou par câbles et débusquage, selon les caractéristiques du site. Les arbres sénescents et à cavité ainsi que les arbres d’avenir à vocation écologique ciblant environ 5 % des tiges en sénescence sont conservés. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ ALLI_01 : 4,23 ha ; ◦ ALLI_03 : 0,87 ha ; ◦ BONS_09 : 25,15 ha ; 92 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 95
◦ NERN_02_05 : 3,12 ha ; ◦ LULLY_03 : 2,87 ha ; ◦ LULLY_04 : 4,28 ha ; ◦ LULLY_07 : 4,16 ha ; ◦ SCIEZ_06 : 1,65 ha. • MC02.4 – Conversion de boisement non indigène : Les arbres non indigènes sont supprimés au sein des parcelles boisées d’espèces non indigènes et monospécifiques afin de favoriser le développement de boisements de feuillus stratifiés ou de boisements mixtes. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ ALLI_01 : 3,13 ha ; ◦ LOIS_18 : 2,26 ha ; ◦ LULLY_02 : 3,91 ha ; ◦ LULLY_03 : 2,31 ha ; ◦ LULLY_04 : 0,75 ha. Les abattages sont réalisés du 1er septembre au 31 octobre en cas d’enjeux chiroptères, jusqu’au 28 février sinon, en présence d’un écologue. Le tassement des sols et la création d’ornières sont évités. La conversion du boisement est mise en œuvre conformément aux modalités conjointes des mesures MC02.1 et MC02.3. • MC02.5 – Régénération naturelle et libre évolution : Le développement de fourrés et de boisements est favorisé par arrêt des mesures de gestion et la mise en œuvre d’une libre évolution du milieu. Les surfaces concernées pour chaque site compensatoire sont les suivantes : ◦ BONS_09 : 0,72 ha ; ◦ NERN_02_05 : 2,9 ha. En fonction des suivis botaniques, des opérations de layonnage ou de sélection de végétation sont réalisées afin d’accélérer la transition vers un milieu forestier. MC03 – Milieux propices aux amphibiens • MC03.1 – Création de mares : Des mares permanentes de 100 m² minimum sont créées sur des sols étanches, en point bas ou sur des zones où la stagnation d’eau a été identifiée, à l’automne/hiver, puis sont maintenues et gérées écologiquement durant toute la phase d’exploitation. Le nombre de mares créées pour chaque site compensatoire sont les suivants : ◦ ALLI_01 : 3 mares ; ◦ ALLI_03 : 2 mares ; ◦ BONS_09 : 3 mares ; ◦ LOIS_18 : 3 mares ; ◦ NERN_02_05 : 7 mares ; ◦ LULLY_02 : 2 mares ; ◦ LULLY_03 : 3 mares ; ◦ SCIEZ_06 : 5 mares ; ◦ CHENS_07 : 2 mares. Les modalités suivantes sont mises en œuvre : ◦ profondeur : 40 cm pour la ceinture externe, 100 cm pour la ceinture interne et 130 cm au centre de la mare ; 93 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 96
◦ régalage autour de la mare sans modification du relief et altération du fonctionnement de la zone humide ou exportation hors zone humide ; ◦ pente douce inférieure à 15 % sur les berges nord et ouest ; ◦ forme arrondie naturelle ; ◦ végétalisation spontanée des berges afin de favoriser les espèces pionnières ; ◦ exposition au soleil : absence de boisement à l’est et au sud à moins de 20 m ; ◦ absence de haies et de boisements à l’ouest afin de limiter l’apport de feuilles dans le milieu aquatique. Le cas échéant, une protection des mares est mise en place afin de limiter tout ou partie de l’accès au bétail. La localisation précise des mares est définie par des sondages pédologiques préalables. • MC03.2 – Restauration de mares existantes : Une restauration des mares présentes au sein des sites compensatoires est réalisée selon les modalités suivantes, sous le contrôle d’un écologue : ◦ débroussaillage des berges du 1er septembre au 28 février ; ◦ reprofilage des berges le cas échéant ; ◦ curage doux en période hivernale pour les mares encore en eau en conservant une zone refuge pour la faune et stockage des boues pendant 3 jours sur les berges afin de permettre la fuite des individus éventuels ; ◦ curage total et remodelage pour les mares à sec. Le nombre de mares restaurées pour chaque site compensatoire sont les suivants : ◦ ALLI_01 : 2 mares ; ◦ ALLI_03 : 5 mares. • MC03.3 – Création de fossés et ornières : Un réseau de points bas est réalisé sur le parcours de fossé garantissant une alimentation en eau lors d’évènements pluvieux puis sa rétention. Les fossés sont étanchéifiés le cas échéant avec de l’argile. Les dénivellations sont en moyenne de 30 cm afin de garantir la rétention de l’eau pendant au moins 40 jours pendant la période de reproduction du Sonneur à ventre jaune. Des opérations d’entretien régulières sont réalisées en hiver par curage et faucardage. Cette mesure concerne la création ou la restauration de 1300 ml de fossés répartis au sein des sites compensatoires. MC04 – Milieux bocagers • MC04.1 – Création ou restauration de haies multi-strates ou arbustives Les haies des sites compensatoires font l’objet d’une restauration écologique. Les haies plantées sont par défaut des haies hautes multi-strates réalisées sur deux à trois rangées. Les modalités de plantation sont précisées dans chaque plan de gestion selon les recommandations de la Mission Haie Auvergne-Rhône-Alpes et soumis à validation de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal- ara@developpement-durable.gouv.fr). Les linéaires de haies plantées pour chaque site compensatoire sont les suivants : ◦ ALLI_01 : 84 ml ; ◦ NERN_02_05 : 2 997 ml ; ◦ BALL_14 : 2 479 ml. 94 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 97
Un linéaire complémentaire de 1000 ml est planté sur un quatrième site, selon une localisation et des modalités transmises pour validation à la DREAL (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) dans un délai de huit mois suivant la signature du présent arrêté. Les plantations sont réalisées entre novembre et mars après préparation du sol. Les essences plantées sont adaptées aux conditions édaphiques locales ; il s’agit exclusivement d’espèces autochtones sauvages (excluant toute variété ornementale), si possible labellisées « Végétal local » ou, à défaut, bénéficiant d’un label équivalent. La liste (non exhaustive) des espèces indicatives pouvant être utilisées est la suivante : ◦ haies bocagères : Troène commun, Cornouiller sanguin, Aubépine monogyne, Fusain d’Europe, Prunellier, Sureau noir, Noisetier, Viorne lantane, Pommier sauvage, etc. ; ◦ arbres : Chêne pédonculé, Chêne sessile, Alisier torminal, Merisier, Tilleul, etc. Les linéaires de haies sont accompagnés d’une bande enherbée d’une largeur minimale de 1 mètre. Les sujets plantés font l’objet d’une surveillance annuelle pendant 5 ans et sont remplacés si nécessaire. Toutes les espèces choisies pour être semées ou plantées font l’objet d’une validation par l’écologue en charge du suivi des sites compensatoires. Une gestion des haies par libre évolution est mise en œuvre sans limite de durée. Les haies en bordure de parcelles agricoles ne font l’objet d’une gestion par taille adaptée, selon les modalités du titre VII du présent arrêté, en lien avec l’opérateur de suivi, qu’en cas de danger pour les biens ou les personnes. Suivi des mesures de compensation Les mesures de compensation sont suivies par un écologue qui veille à leur mise en œuvre. Elles font l’objet d’un suivi scientifique pendant toute la durée de la phase d’exploitation, afin de contrôler leur efficacité, l’évolution des habitats en présence et d’adapter au besoin la gestion mise en place. Il comprend a minima, selon des protocoles adaptés aux espèces présentes sur chacun des sites et reproductibles détaillés pour chaque site de compensation au sein de chaque plan de gestion : • un suivi de la flore et des habitats (deux passages annuels a minima, entre le 15 avril et le 15 septembre) ; • un suivi de l’avifaune (deux passages annuels entre le 1er mars et le 15 juin) ; • un suivi des amphibiens (un à deux passages annuels en période de reproduction en fonction des sites de compensation) ; • un suivi des mammifères (2 passages annuels, les protocoles mis en œuvre sont précisés dans le premier rapport de suivi). Le suivi scientifique des mesures de compensation est réalisé tous les ans les années n+1, n+3, n+5, n+10, n+15, n+20, n+25, n+30 (l’année n correspond à l’année de mise en œuvre de chaque mesure de compensation) puis tous les 10 ans sur toute la durée de la phase d’exploitation. L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. Des rapports de suivi intégrant le rapport annuel de suivi de chantier décrit à la mesure MA9 (pendant toute la phase chantier) et les résultats des suivis scientifiques sont produits et transmis en version informatique à la DREAL (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr), au plus tard le 31 janvier suivant l’année concernée. Ils présentent pour chaque mesure : • les actions mises en œuvre dans l’année n avec le détail des travaux réalisés (dates, modalités) ; techniques, etc.), coûts engendrés et les difficultés éventuelles rencontrées ; • le récapitulatif des mesures de gestion déployées dans l’année ; • les résultats détaillés des suivis scientifiques (résultats bruts) et un diagnostic de ces derniers au regard des objectifs fixés à chaque mesure ; 95 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 98
• la liste des travaux et mesures de gestion prévisionnelles pour l’année suivante ou pour le pas de temps allant jusqu’au prochain suivi scientifique. Le cas échéant, le bénéficiaire détaille la manière dont les résultats des suivis induisent une ré- orientation des mesures de gestion futures, au regard des objectifs de résultat fixés pour chaque mesure de compensation. Chaque mesure fait l’objet d’une fiche synthétique de suivi selon la trame de l’annexe 20. Cette fiche est renseignée initialement dans le premier rapport de suivi ci-avant cité. Elle est ensuite reprise et incrémentée dans chaque rapport de suivi tout au long de sa mise en œuvre. ARTICLE 30.4 Mesures d’accompagnement MA1 – Création de gîtes à chiroptères Des gîtes artificiels favorables aux chiroptères sont implantés en période hivernale, de façon à ne pas être exposés directement au soleil. Plusieurs types de gîtes différents sont utilisés en fonction des secteurs d’implantation. Les bâtiments existants peuvent être aménagés de manière à les rendre favorables pour les chiroptères selon les modalités suivantes : • renforcement de la toiture ; • cloisonnement des combles et des caves ; • création d’ouverture permettant l’accès aux combles tout en ne permettant pas l’accès aux rapaces nocturnes. Leur nombre et leur localisation sont définis avec un écologue, après validation de la DREAL (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). Les gîtes utilisés sont de préférence des gîtes auto-nettoyants. A défaut, ils font l’objet d’un nettoyage aussi souvent que nécessaire (sans produit de nettoyage) entre mi-septembre et mi-octobre pendant une durée minimale de 30 ans. MA2 – Création d’hibernacula Des hibernacula sont créés en période hivernale, leur nombre et leur localisation sont définis par un écologue, après validation de la DREAL (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). Chaque hibernaculum est aménagé sur un emplacement ensoleillé dans un trou d’environ 60 cm de profondeur, selon les modalités suivantes : ◦ creusement d’une fosse de 2 à 3 m de diamètre ; ◦ comblement du fond de la fosse par des matériaux de granulométrie 100 / 200 mm sur une épaisseur de 50 cm ; ◦ comblement avec un mélange de débris végétaux et de blocs minéraux jusqu’à une hauteur de 1 m au-dessus du terrain naturel ; ◦ apport de terre végétale sur une épaisseur minimale de 15 cm afin de constituer une couche enherbée et maintien d’un pierrier sommital ; ◦ aucune utilisation de mortier. MA3 – Installation d’une clôture spécialisée grands carnivores Une clôture spécifique « grands carnivores » est installée sur une longueur minimale de 300 m à l’ouest et de 200 m à l’est du passage grande faune PTF18 dans le sens Machilly-Thonon ainsi que dans le sens Thonon-Machilly, soit un total de 1000 m de linéaires cumulés, selon les modalités suivantes : • 3 m de hauteur hors-sol minimum ; • grillage simple torsion galvanisé, haute résistance ; • maille de 3 x 3 cm ; 96 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 99
• bavolet de 50 cm orienté vers le bas à 45° ; • enterrée sur 50 cm ; • aucun barbelé ; • des panneaux anti-vent sont mis en place. La clôture est couplée à une strate arbustive, faisant l’objet d’un entretien régulier sur toute la durée de la phase d’exploitation. Elle est raccordée directement aux dispositifs existants de guidage de la faune et aux accès du PTF18 afin d’assurer un canal unique de franchissement. Ce dispositif peut être appliqué à d’autres secteurs en fonction de l’évolution de la fréquentation de du secteur par l’espèce. Cette mesure est localisée en annexe 24. MA9 – Assistance environnementale en phase travaux par un écologue Le chantier est suivi par un écologue veillant à la mise en œuvre de l’intégralité des mesures d’évitement, de réduction et d’accompagnement (hors sites compensatoires). Ce suivi est constitué a minima des éléments suivants : • Avant travaux (MA9.a) : ◦ actualisation du diagnostic faune/flore ciblant certaines espèces sensibles (arbres à cavités, Castor d’Europe, petits mammifères arboricoles, flore et bryophytes) ; ◦ réunion de démarrage avec présentation de l’intervention de l’écologue et de l’organisation du chantier ; ◦ sensibilisation à l’écologie d’espèces particulières (Castor d’Eurasie) ; ◦ organisation du chantier (évitement des périodes de sensibilité) (MR1) ; ◦ balisage et mise en défens des zones évitées (cours d’eau en faveur du Castor, stations floristiques patrimoniales, zones humides) (ME1, ME2, ME3, ME5) ; ◦ balisage, déplacement et transplantation des plantes patrimoniales (MR14, MR20, MA11) ; ◦ balisage et indication des espèces exotiques envahissantes pour gestion (MR15) ; ◦ balisage des terriers de Castor le cas échéant et sensibilisation de l’équipe chantier à cette problématique (MR11) ; ◦ réalisation de pêches électriques de sauvetages (MR9, MR16) ; ◦ validation des mélanges grainiers, des espèces plantées (MR18) ; • Pendant travaux (MA9.b) : ◦ sensibilisation des chefs de chantier et de l’ensemble du personnel (MA10) ; ◦ installation des barrières pour la petite faune (amphibiens) (MR9) ; ◦ prospection : vérification que les zones de chantier ne soient pas colonisées par des espèces animales/végétales protégées et prise de mesures si nécessaire (transfert), après porter à connaissance auprès de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes si celles-ci ne sont pas visées par la présente dérogation (voir article 54) ; ◦ vérification des mesures d’évitement spatial et d’évitement des zones balisées (ME1, ME2, ME3, ME5) ; ◦ vérification du respect des dates de sensibilité de la faune (MR1) ; ◦ vérification des mesures de prévention contre le risque de développement des espèces végétales exotiques envahissantes (EVEE) et suivi de celles-ci, lutte contre les EVEE (MR15) ; ◦ accompagnement des mesures de défavorabilisation (MR9, MR10, MR11, MR12, MR19, MR20) ; ◦ accompagnement des abattages d’arbres (MR1, MR10) ; ◦ opérations de sauvetage des espèces protégées (MR9, MR12). L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions par un suivi régulier du chantier et de leur restitution dans les rapports de suivi transmis notamment à la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) à fréquence mensuelle en phase chantier. 97 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 100
MA10 – Sensibilisation des équipes chantier Une démarche de sensibilisation ciblée auprès de l’ensemble des intervenants est mise en œuvre avant et pendant les travaux par un écologue et/ou les responsables environnement sur les points suivants : • respect des horaires de chantier ; • utilisation d’un éclairage orienté à intensité réduite et extinction systématique des projecteurs et éclairages hors période d’activité ; • informations sur les effets du bruit sur la faune ; • présentation des espèces à enjeu présentes sur le tracé ou à proximité, les comportements à adopter en cas de rencontre avec la faune ou découverte de flore à enjeu ; • informations sur le risque de dissémination d’espèces exotiques envahissantes ; • affichage des fiches espèces et zones à enjeux aux points stratégiques du chantier (base-vie, stockages, zones sensibles) ; • respect des limitations de vitesse ; • respect des zones sensibles ; • réunions préalables aux phases à risque (déboisement, travaux en cours d’eau, reprise après interruption etc.). MA11 – Protocole expérimental de mise en culture et de réintroduction de Buxbaumia viridis Un protocole expérimental, présenté en annexe 29.b de mise en culture est mis en place dans le cas où le déplacement de supports colonisés par l’espèce n’est pas envisageable à proximité. Le Conservatoire Botanique National Alpin (CBNA) et la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) sont informés du déroulé des opérations, des résultats et de toutes modifications du protocole. Les supports colonisés sont placés en conditions contrôlées pour favoriser la croissance de gaméophytes et la reproduction. Après stabilisation, les colonies sont réintroduites au sein des sites compensatoires favorables (voir MC02). Une mise en défens des zones transplantées est mise en place à l’aide d’une barrière physique visible. Les zones transplantées sont laissées en libre évolution et la plantation dense et les travaux forestiers à proximité sont proscrits sur toute la durée de la phase d’exploitation. Cette mesure est localisée en annexe 22. MA12 – Protocole de translocation expérimental de colonies gamétophytiques de Buxbaumia viridis Le protocole, présenté en annexe 29.b, est mis en place par un bureau d’études spécialisé. Le CBNA et la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) sont informés du déroulé des opérations, des résultats et de toutes les modifications du protocole. Cette mesure est localisée en annexe 22. MA13 – Contribution financière au PNA en faveur du Lynx boréal À compter de la délivrance de la présente autorisation, le pétitionnaire contribue financièrement au plan national d’actions (PNA) en faveur du Lynx boréal, sur toute la durée de l’autorisation, par versement annuel d’un montant de 50 000 € (cinquante mille euros) aux actions relevant du PNA. L'affectation entre actions de ce PNA est validée par un groupe de travail dont la composition est arrêtée par la DREAL Auvergne Rhône-Alpes. Ce groupe de travail se réunit pour la première fois dans l’année suivant la signature du présent arrêté, sous la présidence du préfet coordonnateur du PNA ou son représentant, et sur proposition du bénéficiaire. 98 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 101
Le bénéficiaire est chargé de son secrétariat, incluant l’élaboration de l’ordre du jour, la transmission des convocations, la rédaction et diffusion de son compte-rendu. Les documents sont validés par le préfet coordonnateur du PNA ou son représentant, avant diffusion aux participants de ce groupe de travail. MA14 – Mesures spécifiques au Grand Capricorne Avant le démarrage des travaux d’abattage par zone nouvellement impactée, tel que défini en annexe 27, l’ensemble des arbres au sein de l’emprise des travaux favorables au Grand Capricorne font l’objet d’un diagnostic préalable par un écologue afin de vérifier l’absence de spécimens. Dans le cas où la présence de l’espèce est avérée, les travaux sont suspendus et de nouvelles mesures sont proposées et mises en œuvre après validation de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr). L’écologue s’assure de la traçabilité des différentes actions et de leur restitution dans les rapports de suivi. MA15 – Amélioration des connaissances sur le Carabe noduleux Une classification des enjeux relatifs aux portions de cours d’eau potentiellement favorables à l’espèce est établie sur l’ensemble des linéaires des ruisseaux d’Avully, de la Creuse, des Communes, du Redon, du Pamphiot, de la Gorge et du Foron, présents au sein de l’emprise travaux, ainsi que sur les linéaires avals de cours d’eau présents en continuité hydraulique avec les cours d’eau traversés par le projet. Cette classification, en 4 niveaux d’enjeux, s’appuie sur des critères qualitatifs rigoureux, croisant l’intégrité fonctionnelle globale du réseau lotique, la densité et la représentativité des micro-habitats ainsi que l’historique des données de répartition de l’espèce. L’état de conservation de l’espèce fait l’objet d’un suivi en année n+1, n+2, n+3, n+5 et n+10 (n étant l’année de signature du présent arrêté), à raison d’1 passage minimum par an, par prospection active crépusculaire et à la nuit tombée. Les rapports de suivi sont transmis à la DREAL (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) avant le 31 janvier de l’année suivant la réalisation du suivi. TITRE V – PRESCRIPTIONS PARTICULIÈRES RELATIVES AU SITE NATURA 2000 ARTICLE 31 Mesures spécifiques aux zones Natura 2000 Le bénéficiaire est tenu d’assurer la mise en œuvre rigoureuse des mesures prévues dans le dossier d’autorisation, ainsi que dans le présent arrêté, en particulier le titre IV. Un dispositif de suivi renforcé devra être mis en place afin de contrôler la bonne application des mesures prescrites, d’évaluer leur efficacité et, le cas échéant, de proposer les adaptations nécessaires. Le pétitionnaire s’engage à contribuer à la conservation du Glaïeul des marais présent aux abords des emprises du projet, notamment par un appui technique à la mise en œuvre d’actions de restauration et/ou de renaturation des habitats favorables à cette espèce. Ces actions pourront, le cas échéant, inclure des opérations de renforcement ou de réimplantation de populations, sous réserve que leur faisabilité écologique soit démontrée et qu’elles soient conduites selon les règles de l’art. 99 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 102
Les actions mises en œuvre devront être définies et réalisées en lien étroit avec la structure porteuse et animatrice du site Natura 2000 des zones humides du Bas Chablais, afin d’assurer leur cohérence avec les objectifs de conservation du site. Le pétitionnaire pourra pour cela contribuer financièrement à certaines actions au travers des dispositions du Fonds d'intervention pour le patrimoine naturel (FIPAN) dédié au projet. Le pétitionnaire justifiera de son engagement et de la réalisation de cette mesure au travers du comité de suivi des mesures environnementales. TITRE VI - PRESCRIPTIONS PARTICULIÈRES RELATIVES AUX ALIGNEMENTS D’ARBRES ARTICLE 32 Localisation et consistance des travaux Les travaux autorisés comprennent (voir plan en annexe 32) : - l’abattage des arbres situés dans l’emprise directe des terrassements et aménagements du projet ; - le dessouchage, limité aux zones où il est nécessaire à la stabilité des ouvrages ou à la sécurité des terrassements ; - la préparation du terrain en vue de la réalisation de la plateforme autoroutière et des aménagements associés ; - l’évacuation et la valorisation des produits de coupe dans des conditions conformes à la réglementation applicable. Les segments des alignements situés hors emprise des travaux ne font l’objet d’aucune autorisation d’atteinte au titre du présent arrêté. ARTICLE 33 Prescriptions générales Le bénéficiaire met en œuvre l’ensemble des mesures d’évitement, de réduction et de compensation décrites dans son dossier de demande, sous réserve des prescriptions complémentaires du présent arrêté. Le bénéficiaire informe préalablement le service chargé de la police de l’eau et de la nature de la date prévisionnelle de démarrage des opérations d’abattage au moins quinze jours avant le commencement des travaux. ARTICLE 34 Prescriptions environnementales préalables aux travaux Les opérations d’abattage sont réalisées selon les modalités techniques des mesures MR1.a, MR10.a et MR10.b (article 30.2). ARTICLE 35 Calendrier d’exécution Les opérations de destruction autorisées au titre du présent arrêté sont mises en œuvre conformément aux modalités techniques de la mesure MR1.a (article 30.2). ARTICLE 36 Compensation Le bénéficiaire met en œuvre la mesure de compensation prévue au dossier, dont le plan de localisation est donné en annexe 32, consistant en la création, à Machilly, le long de la voie douce ViaRhôna, d’un alignement arboré d’environ 200 mètres linéaires composé de 21 érables sycomores. 100 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 103
Cette mesure de compensation est réalisée au plus tard à la fin de l’année 2028, conformément au calendrier annoncé dans le dossier. Le bénéficiaire transmet au préfet et à la direction départementale des territoires, dans un délai de deux mois suivant l’achèvement des plantations, un compte rendu de réalisation précisant au minimum la localisation exacte, le linéaire planté, le nombre de sujets effectivement mis en terre, les essences retenues et, le cas échéant, les écarts par rapport au dossier initial. Tout échec significatif de reprise constaté dans le cadre du suivi des plantations donne lieu à remplacement des sujets concernés dans des conditions assurant la pérennité de la compensation. TITRE VII - PRESCRIPTIONS PARTICULIÈRES RELATIVES AUX HAIES ARTICLE 37 Localisation et consistance des travaux Les travaux autorisés comprennent la suppression d’un total de 2 839 ml de haies champêtres et alignements d’arbres répartis sur l’ensemble des 16 km de l’emprise. ARTICLE 38 Prescriptions générales Le bénéficiaire met en œuvre l’ensemble des mesures d’évitement, de réduction et de compensation décrites dans son dossier de demande, sous réserve des prescriptions du présent arrêté. Le bénéficiaire informe la DDT de la Haute-Savoie (ddt-see@haute-savoie.gouv.fr), la DREAL Auvergne- Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr) et l’OFB (sd74@ofb.gouv.fr) de la date prévisionnelle de démarrage des opérations de destruction au moins une semaine avant le commencement des travaux. ARTICLE 39 Prescriptions environnementales préalables aux travaux Avant toute opération de destruction de haies, un contrôle écologique préalable est réalisé par un écologue compétent afin de vérifier l’absence d’enjeux faunistiques nécessitant l’adaptation des modalités d’intervention. En cas de découverte d’un indice de présence faunistique, notamment de nidification, les travaux concernés sont suspendus et les mesures adaptées sont définies avant reprise de l’intervention. Les opérations de destruction sont réalisées selon les modalités techniques de la mesure MR1.a (article 30.2). ARTICLE 40 Calendrier d’exécution Les opérations de destruction autorisées au titre du présent arrêté sont mises en œuvre entre le 1er septembre et le 28 février. ARTICLE 41 Compensation Le bénéficiaire met en œuvre les mesures de compensation prévues au dossier consistant en la plantation d'un linéaire total d'environ 12 506 mètres de haies, avant la mise en service de l’autoroute, comprenant : • des haies plantées sur les parcelles de compensation au titre des atteintes aux espèces protégées, pour un linéaire minimum de 6 506 mètres, selon les modalités techniques de la mesure MC04 (titre IV) ; • des haies implantées à proximité des ouvrages de transparence écologique afin d'assurer la fonctionnalité des corridors écologiques, pour un linéaire d'environ 3 500 mètres, selon les modalités techniques de la mesure MR6 (titre IV) ; • des haies réalisées dans le cadre des aménagements paysagers, constituant notamment des ressources alimentaires, des zones de refuge et des sites de reproduction pour la faune, pour un linéaire d'environ 2 500 mètres, selon les modalités techniques suivantes : 101 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 104
◦ utilisation d’essences arborées et arbustives indigènes adaptées aux conditions stationnelles locales (Troène commun, Cornouiller sanguin, Aubépine monogyne, Fusain d'Europe, Prunellier, Sureau noir, Noisetier, Viorne lantane, Pommier sauvage, Chêne pédonculé, Chêne sessile, Alisier torminal, Merisier et Tilleul) ; ◦ plantation en simple ou double rang (largeur minimale de 2 m, en quinconce) avec intégration d’essences de hauts-jets tous les 20 à 30 m selon les conditions environnementales ; ◦ espacement des plants de 1,3 m ; ◦ réalisation des plantations entre le 1er novembre et le 15 mars, après préparation du sol le cas échéant ; ◦ mise en place d’un paillage biodégradable ; ◦ mise en place d’une protection des jeunes plants contre le gibier ; ◦ maintien d’une bande enherbée d’au moins 1 m de part et d’autre de la haie ; ◦ l’utilisation d’engrais chimique et de produits phytosanitaires est proscrite. Le bénéficiaire assure la garantie de reprise des plantations. Les plants morts sont remplacés annuellement durant les trois premières années suivant la plantation. À l'issue de cette période, lorsque le taux de reprise est inférieur à 80 % ou que des discontinuités de plus de cinq mètres subsistent, des plantations complémentaires sont réalisées afin de garantir l'atteinte des objectifs de compensation. Les haies sont conduites en haies hautes. Leur entretien est réalisé entre le 1er septembre et le 28 février, selon des techniques compatibles avec la préservation de la biodiversité. L'utilisation de l'épareuse est proscrite, sauf impossibilité technique dûment justifiée. Le bénéficiaire transmet à la DDT de la Haute-Savoie (ddt-see@haute-savoie.gouv.fr) et à la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes (pme.ehn.dreal-ara@developpement-durable.gouv.fr), dans un délai de deux mois suivant l'achèvement des plantations, un compte rendu de réalisation précisant notamment la localisation des haies, les linéaires effectivement plantés, les essences utilisées, les modalités de plantation mises en œuvre ainsi que tout écart éventuel par rapport aux dispositions prévues au dossier. Le bénéficiaire transmet également les bilans de reprise des plantations réalisés au cours des trois premières années suivant leur mise en œuvre, en précisant les éventuels compléments de plantation réalisés afin d'assurer la pérennité des mesures compensatoires. TITRE VIII - PRESCRIPTIONS PARTICULIÈRES RELATIVES AUX IMPACTS SUR L’AGRICULTURE ARTICLE 42 Indemnisations individuelles Afin de réduire l’impact sur la filière, il est demandé aux maîtres d’ouvrages d’indemniser individuellement chacune des exploitations identifiées comme impactées directement par le projet, et de mettre en œuvre pour chacune d’entre elles les échanges de parcelles envisageables sur la base du volontariat des différentes parties de l’échange pour minimiser leur préjudice. ARTICLE 43 Phase travaux et post-travaux Il est demandé au bénéficiaire : - d’informer au préalable à toute intervention et au moins plusieurs semaines en avance des dates prévues les personnes impactées par les travaux : les propriétaires des terrains impactés, les exploitants agricoles, ainsi que les propriétaires riverains ; - d’organiser au moins une fois par trimestre des réunions avec les exploitants en fonction de la progression du chantier. Ces réunions, pour lesquelles la Chambre interdépartementale d’agriculture Savoie Mont-Blanc est invitée, permettront d’acter conjointement les modalités d’avancement des travaux et d’assurer la bonne compréhension réciproque des contraintes de chacune des parties. 102 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 105
Des réunions pourront également être organisées par les maîtres d’ouvrages sur demande des exploitants ou de la Chambre d’agriculture ; - de réduire l'emprise au sol du chantier au maximum et de piqueter de façon à minimiser les impacts sur le milieu agricole et naturel, y compris pour les débroussaillages et déboisements ; - d’assurer durant la phase de travaux le maintien des circulations agricoles avec des gabarits nécessaires aux engins agricoles, l’accès à l’ensemble des parcelles non impactées, puis la remise en état agricole en respectant les préconisations de la Chambre d’agriculture ; avec notamment la recherche de sites pour la mise en dépôt des remblais et la mise en place d’une mission de suivi agronomique des terres redéposées sur des surfaces agricoles ; - de faire respecter par les entreprises en charge des travaux certaines consignes particulières à l’approche des zones pâturées : circulation des engins au pas à proximité des troupeaux, divagation des engins interdite sur les zones de prairies… - d’indemniser les exploitants concernés par des pertes temporaires de production ou des dégradations de parcelles. - de garantir au terme des travaux le rétablissement de l’ensemble des accès aux parcelles exploitées ; À la fin de la phase travaux, il est demandé aux maîtres d’ouvrages d’assurer un suivi agronomique des secteurs agricoles ayant servi de dépôt, qui feront l’objet d’une remise en état agricole le plus rapidement possible. Cette remise en état respectera les préconisations qui seront fournis par la Chambre d’agriculture, notamment en ce qui concerne les espèces et essences à utiliser pour ré- enherber les surfaces. Aux endroits qui auront été enherbés ou végétalisés (plantations), un suivi de la reprise de la végétation sera réalisé par les maîtres d’ouvrages pendant au moins 5 ans après les travaux. Les déblais seront intégralement réutilisés sur l’emprise du projet, et ne pourront faire l’objet d’aucun dépôt définitif sur des terrains à vocation agricole extérieurs au projet. ARTICLE 44 Compensation collective agricole AMEDEA devra verser la somme de 3 478 223 € au fonds départemental de compensation collective, dans l’attente de la définition des mesures de compensation. Les bénéficiaires participeront à la compensation collective agricole en versant un montant de compensation complémentaire compris entre 39 286 € et 101 568 €, selon l’option choisie quant au maintien ou à la délocalisation du site d’exploitation agricole situé sur les parcelles B1032 et B2381 sur la commune de Perrignier. Si des surfaces agricoles non prises en compte dans l’étude préalable agricole déjà réalisée ou son complément venaient à perdre leur caractère agricole du fait du projet, l’impact de ce changement d’affectation devra faire l’objet d’un nouveau complément à l’étude préalable agricole. ARTICLE 45 Mesures de compensations collectives Il est demandé aux maîtres d’ouvrage : - de participer à un groupe de travail pour la définition des mesures de compensation collectives agricoles ; - de fournir un bilan annuel des mesures mises en œuvre (montants financiers engagés, avancement des projets, délais, résultats obtenus…) ; - de s’engager sur le délai de mise en œuvre de la compensation collective, d’ici 5 ans au plus tard après la réalisation des travaux. Une fois les mesures identifiées, celles-ci feront l’objet d’une nouvelle consultation de la CDPENAF et d’un avis complémentaire du Préfet de département. Il est demandé aux maîtres d’ouvrage d’assurer que les aménagements de voirie définitifs soient définis en concertation avec la Chambre d’agriculture Savoie Mont Blanc, afin de prendre en compte les contraintes de circulation des engins agricoles qui seront amenés à les utiliser et d’ainsi minimiser les nuisances pour ceux-ci (chicanes, bordures de voies, ralentisseurs ...). 103 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 106
Il est demandé aux maîtres d’ouvrage de maintenir des échanges de concertation avec la Chambre d’agriculture pendant au moins 5 ans après la mise en exploitation de l’infrastructure, à hauteur d’au moins une réunion par an, afin d’assurer le suivi de l’ensemble des impacts pour le secteur agricole, notamment en ce qui concerne : les circulations routières, la cohabitation d’usage sur les voies cyclables partagées, l’évolution de la fréquentation des magasins de producteurs du périmètre d’impact et l’effectivité des remises en état des occupations temporaires sur terrains agricoles. TITRE IX - PRESCRIPTIONS SPÉCIFIQUES LIÉES AUX INSTALLATIONS CLASSÉES POUR LA PROTECTION DE L’ENVIRONNEMENT ARTICLE 46 Exploitation, durée et péremption Les installations décrites ci-après sont enregistrées. L’enregistrement cesse de produire effet lorsque, sauf cas de force majeure, les installations n’ont pas été mises en service dans le délai de trois ans ou lorsque l’exploitation a été interrompue plus de deux années consécutives (article R. 512-74 du code de l’environnement). ARTICLE 47 Situation Les installations enregistrées sont situées sur les communes suivantes : - communes de Bons-en-Chablais et Loisin pour la plateforme accueillant des activités de concassage, criblage de matériaux (rubrique 2515) adossée à une station de transit de matériaux inertes (rubrique 2517) aménagée au PK 1+600 du projet ; - commune d’Allinges pour la plateforme accueillant des activités de concassage, criblage de matériaux (rubrique 2515) adossée à une plateforme de transit de matériaux inertes (rubrique 2517) aménagé au PK 14+300 ; - commune de Perrignier pour la centrale d’enrobage (rubrique 2521) adossée à une station de transit de matériaux inertes (rubrique 2517) aménagé au PK 10+100 du projet. La localisation des emprises des installations est donnée à l’annexe 33. Ces installations sont reportées sur un plan de situation tenu à jour et, en permanence, à la disposition du service de l’inspection des installations classées. ARTICLE 48 Conformité au dossier d’enregistrement Les installations et leurs annexes, objet du présent article, sont disposées, aménagées et exploitées conformément aux plans et données techniques contenus dans le dossier déposé par l’exploitant. Elles respectent les dispositions des arrêtés ministériels de prescriptions générales applicables susvisés et rappelés à l’article 50 du présent arrêté. ARTICLE 49 Mise à l’arrêt définitif En cas de fermeture ou de cessation définitive d’une installation soumise à enregistrement l’exploitant doit adresser au préfet la notification prévue par l’article R. 512-46-25 du code de l’environnement trois mois au moins avant l’arrêt de ladite installation. Après l’arrêt définitif des installations, les sites sont remis en état suivant le descriptif de la demande d’enregistrement, pour un usage compatible avec le plan local d’urbanisme. 104 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 107
ARTICLE 50 Prescriptions techniques applicables S’appliquent aux installations, les prescriptions de : • l'arrêté ministériel du 26 novembre 2012 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations du régime de l'enregistrement relevant de la rubrique n° 2515 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l'environnement ; • l'arrêté ministériel du 10 décembre 2013 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations du régime de l'enregistrement relevant de la rubrique n° 2517 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l'environnement ; • l'arrêté ministériel du 9 avril 2019 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations du régime de l'enregistrement relevant de la rubrique n° 2521 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l'environnement ; • l’arrêté ministériel du 30 juin 1997 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations de production de parois moulées, soumises à déclaration sous la rubrique n° 2515 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l’environnement ; • l’arrêté du 26 novembre 2011 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations de fabrication de béton prêt à l’emploi, soumises à déclaration sous la rubrique n° 2518 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l’environnement ; • l'arrêté ministériel du 3 août 2018 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations classées du régime de déclaration relevant de la rubrique n°2910 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l'environnement ; • l’arrêté du 29 mai 2000 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations classées pour la protection de l'environnement soumises à déclaration sous la rubrique n° 2925 “ accumulateurs (ateliers de charge d') ” - (Rubriques n°2925-1 et n° 2925-2) ; • l'arrêté du 23 août 2005 relatif aux prescriptions générales applicables aux installations classées du régime de déclaration relevant de la rubrique n° 4718 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l'environnement ; • l'arrêté du 5 décembre 2016 relatif aux prescriptions applicables à certaines installations classées du régime de déclaration relevant de la rubrique n°4801 de la nomenclature des installations classées pour la protection de l'environnement. TITRE X - PRESCRIPTIONS SPÉCIFIQUES AUX MONUMENTS HISTORIQUES ET SITES INSCRITS ARTICLE 51 Prescriptions spécifiques aux monuments historiques Afin d’intégrer l’infrastructure autoroutière dans le paysage et de limiter les impacts visuels et sonores vis-à-vis du monument historique, des bosquets d'arbres d'essences locales, de hauteurs variées et disposés en épis le long de l'autoroute, sont implantés entre les PK 8+100 et 8+700, côté château de Buffavent, en complément ou remplacement selon le cas, de la haie continue prévue dans le projet. Un document graphique complémentaire sera soumis pour validation de l'Architecte des Bâtiments de France (ABF) avant l’exécution des travaux. Une frange forestière d'épaisseur suffisante est conservée ou restituée entre l'autoroute et les infrastructures de l'abbaye du Lieu, y compris la clairière associée. Les plantations sont conçues et entretenues de manière à assurer durablement la préservation des perceptions paysagères des monuments historiques inscrits. Toute modification du projet par rapport aux éléments présentés dans le dossier de demande d'autorisation environnementale, lorsqu'elle est située dans le périmètre de protection de 500 mètres d'un monument historique inscrit, est soumise à l'accord préalable de l'ABF. 105 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 108
ARTICLE 52 Prescriptions spécifiques aux sites inscrits La réouverture de milieux prévus dans le cadre de la mise en œuvre des mesures compensatoires dans le site inscrit du château de Chignans préservera une bande boisée le long de la RD 903 d'une largeur minimale de 15 mètres. La mise en œuvre de la mesure compensatoire dans le site inscrit de la chapelle Notre dame du lac et ses abords à Nernier sera réalisée de manière à conserver les plantations récentes d'arbres d'alignement le long de la route de la chapelle. TITRE XI - DISPOSITIONS FINALES ARTICLE 53 Durée de l’autorisation, délai de mise en œuvre et demande de prorogation L’autorisation est accordée pour la durée de concession, soit 55 ans. L’arrêté d’autorisation environnementale cesse de produire effet lorsque le projet n’a pas été mis en service ou réalisé dans un délai de 5 ans à compter du jour de la notification du présent arrêté, sauf cas de force majeure ou de demande justifiée et acceptée de prorogation de délai et sans préjudice des dispositions des articles R. 211-117 et R. 214-97 du code de l’environnement. Ce délai est suspendu jusqu'à la notification au bénéficiaire de l'autorisation environnementale : 1° D'une décision devenue définitive en cas de recours devant la juridiction administrative contre l'arrêté d'autorisation environnementale ou ses arrêtés complémentaires ; 2° D'une décision devenue définitive en cas de recours devant la juridiction administrative contre le permis de construire du projet ou la décision de non-opposition à déclaration préalable ; 3° D'une décision devenue irrévocable en cas de recours devant un tribunal de l'ordre judiciaire, en application de l'article L. 480-13 du code de l'urbanisme, contre le permis de construire du projet. La demande de prolongation ou de renouvellement de l’autorisation environnementale est adressée au préfet par le bénéficiaire six mois au moins avant la date d'expiration de cette autorisation. La demande présente notamment les analyses, mesures et contrôles effectués, les effets constatés sur le milieu et les incidents survenus, ainsi que les modifications envisagées compte tenu de ces informations ou des difficultés rencontrées dans l'application de l'autorisation. Elle précise également les dispositions envisagées concernant la poursuite de la mise en œuvre des mesures compensatoires, tant que les atteintes à la biodiversité générées par le projet persistent. Les mesures compensatoires existantes sont maintenues ou, le cas échéant, de nouvelles mesures présentant une efficacité écologique au moins équivalente sont proposées par le nouveau bénéficiaire de l’autorisation environnementale, afin de garantir le respect de l’objectif d’absence de perte nette de biodiversité. Ces adaptations sont soumises à l’accord préalable du préfet. La demande de prolongation ou de renouvellement de l’autorisation environnementale est soumise aux mêmes formalités que la demande d'autorisation initiale si elle prévoit d'apporter une modification substantielle aux activités, installations, ouvrages et travaux autorisés. ARTICLE 54 Modification de l’autorisation Toute modification apportée par le bénéficiaire de l'autorisation environnementale, à l'ouvrage, à l'installation, à son mode d'utilisation, à la réalisation des travaux ou à l'aménagement en résultant ou à l'exercice de l'activité ou à leur voisinage, et de nature à entraîner un changement notable des éléments du dossier de demande d'autorisation, est portée, avant sa réalisation, à la connaissance de la préfète de Haute-Savoie avec tous les éléments d'appréciation, conformément aux dispositions des L. 181-14 et R. 181-45 et R. 181-46 du code de l’environnement. Cette modification peut donner lieu, le cas échéant, à des prescriptions complémentaires conformément à l’article L. 181-14 du code de l’environnement. 106 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 109
La demande de modification comportera a minima : • une note présentant les points modifiés, leur justification et leurs incidences ; • une copie des plans initiaux mettant en évidence les modifications apportées ; • une copie de l’arrêté préfectoral d’autorisation surlignée aux points concernés par les modifications. Toute modification substantielle des activités, installations, ouvrages ou travaux est soumise à la délivrance d'une nouvelle autorisation, qu'elle intervienne avant la réalisation du projet ou lors de sa mise en œuvre ou de son exploitation. ARTICLE 55 Transfert de l’autorisation Le transfert de l'autorisation environnementale fait l'objet d'une déclaration adressée au préfet par le nouveau bénéficiaire dans les 3 mois qui suivent la prise en charge de l'ouvrage, de l'installation, des travaux ou des aménagements ou le début d'exercice de son activité. Elle mentionne, s'il s'agit d'une personne physique, les nom, prénoms et domicile du nouveau bénéficiaire et, s'il s'agit d'une personne morale, sa dénomination ou sa raison sociale, sa forme juridique, l'adresse de son siège social ainsi que la qualité du signataire de la déclaration. Le préfet en accuse réception dans un délai d'un mois. ARTICLE 56 Cessation et remise en état des lieux La cessation définitive, ou pour une période supérieure à deux ans, des travaux, de l'exploitation ou de l'affectation indiquée dans l'autorisation ou la déclaration d'un ouvrage ou d'une installation fait l'objet d'une déclaration par l'exploitant, ou, à défaut, par le propriétaire, auprès du préfet dans le mois qui suit la cessation définitive ou le changement d'affectation et au plus tard un mois avant que l'arrêt de plus de deux ans ne soit effectif. En cas de cessation définitive, il est fait application des dispositions de l'article L . 181-23 du code de l’environnement. La déclaration d’arrêt d’exploitation de plus de deux ans est accompagnée d’une note expliquant les raisons de cet arrêt et la date prévisionnelle de reprise de cette exploitation. Le préfet peut émettre toutes prescriptions conservatoires afin de protéger les intérêts énoncés à l’article L. 181-3 du code de l’environnement pendant cette période d’arrêt. Si l’exploitation n’est pas reprise à la date prévisionnelle déclarée, le préfet peut, l’exploitant ou le propriétaire entendu, considérer l’exploitation comme définitivement arrêtée et fixer les prescriptions relatives à l’arrêt définitif de cette exploitation et à la remise en état du site. ARTICLE 57 Abrogation ou suspension de l’autorisation En cas d’abrogation ou de suspension de la présente autorisation, le bénéficiaire est tenu de prendre toutes les dispositions nécessaires pour assurer la surveillance des aménagements et garantir le bon écoulement des eaux. ARTICLE 58 Déclaration des incidents ou accidents Dès qu’il en a connaissance, le bénéficiaire est tenu de déclarer au préfet les accidents ou incidents intéressant les installations, ouvrages, travaux ou activités faisant l’objet de la présente autorisation qui sont de nature à porter atteinte aux intérêts mentionnés aux articles L. 181-3 et L. 181-4 du code de l'environnement. Sans préjudice des mesures susceptibles d'être prescrites par le préfet, le bénéficiaire est tenu de prendre ou faire prendre les dispositions nécessaires pour mettre fin aux causes de l’incident ou accident, pour évaluer ses conséquences et y remédier. 107 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 110
Le bénéficiaire est responsable des accidents ou dommages imputables à l'utilisation de l'ouvrage ou de l'installation, à la réalisation des travaux ou à l'aménagement en résultant ou à l'exercice de l'activité. ARTICLE 59 Contrôles, accès aux installations et exercice des missions de police Les agents en charge de mission de contrôle au titre du code de l’environnement et du code forestier ont libre accès aux aménagements et travaux relevant de la présente autorisation dans les conditions fixées aux articles L. 171-1 et L. 181-16 du code de l’environnement. Ils peuvent demander communication de toute pièce utile au contrôle de la bonne exécution du présent arrêté. Si nécessaire, le pétitionnaire leur met à disposition les moyens nécessaires permettant d’accéder aux travaux, aux installations ou aux ouvrages. ARTICLE 60 Droits des tiers Les droits des tiers sont expressément réservés. ARTICLE 61 Autres réglementations La présente autorisation ne dispense en aucun cas le bénéficiaire de faire les déclarations ou d'obtenir les autorisations requises par les réglementations autres que celles en application desquelles elle est délivrée. ARTICLE 62 Publication et information des tiers En application de l'article R. 181-44 du code de l'environnement : • une copie de la présente autorisation est déposée aux mairies des communes d'implantation du projet visé à l'article 1er ; • un extrait de la présente autorisation est affiché pendant une durée minimale d'un mois dans les communes d'implantation du projet visé à l'article 1er. Un procès-verbal de l'accomplissement de cette formalité est dressé par les soins des maires ; • la présente autorisation est adressée à chaque conseil municipal et aux autres autorités locales consultées ; • la présente autorisation est publiée sur le site Internet de la préfecture de la Haute-Savoie qui a délivré l'acte, pendant une durée minimale de quatre mois. ARTICLE 63 Voies et délais de recours Cette décision peut faire l'objet d'un recours contentieux en application de l’article R . 181-50 du code de l’environnement : 1° par les tiers intéressés dans un délai de deux mois à compter du premier jour de la publication ou de l'affichage de ces décisions ; 2° par les demandeurs ou exploitants, dans un délai de deux mois à compter de la date à laquelle la décision leur a été notifiée. La présente décision étant soumise au régime contentieux défini par l’article R. 311-5 du code de justice administrative, ce recours doit être porté directement devant la cour administrative d’appel de Lyon, compétente en premier et dernier ressort. Par dérogation, le délai de recours contentieux n’est pas prorogé par l’exercice d’un recours administratif. Il est également possible de saisir la juridiction administrative par le biais du portail "télérecours citoyens", accessible au public à l’adresse suivante : www.telerecours.fr 108 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 111
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Annexes de l’arrêté préfectoral n°DDT-2026-1079 du 28 août 2026 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison autoroutière concédée entre MACHILLY et THONON-LES-BAINS (A412) et de suppression des passages à niveau n°65 et n°66 à PERRIGNIER 1 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 113
Table des annexes Annexe 1 – Plan global de localisation du projet...............................................................4 Annexe 2 – Emprises définitives et provisoires du projet................................................5 Annexe 3 – Tableau de synthèse des mesures ERC-A.....................................................16 Annexe 4 – Localisation des mesures de compensation...............................................20 Annexe 5 – Calendrier prévisionnel de réalisation des travaux....................................38 Annexe 6 - Localisation des cours d’eau concernés par les travaux............................39 Annexe 7 – Ouvrages hydrauliques définitifs...................................................................40 Annexe 8 – Coupes en travers des différents types de reconstitution du lit au sein d’ouvrages cadre...................................................................................................................42 Annexe 9 – Cours d’eau concernés par des dérivations définitives............................45 Annexe 10 – Protections de berge en technique mixte et en technique végétal......46 Annexe 11 – Espèces végétales identifiées pour les plantations rivulaires.................49 Annexe 12 – Caractéristiques et localisation de la compensation des remblais en zone inondables....................................................................................................................50 Annexe 13 – Coupe type d’un bassin d’assainissement provisoire...............................51 Annexe 14 – Niveaux d’enjeux physico-chimique pour chaque cours d’eau récepteur................................................................................................................................52 Annexe 15 – Localisation et caractéristiques des ouvrages de gestion des eaux pluviales définitifs.................................................................................................................53 Annexe 16 – Classe de qualité des cours d’eau...............................................................56 Annexe 17 – Qualité des rejets............................................................................................57 Annexe 18 – Localisation des zones humides impactées par le projet.......................58 Annexe 19 – Cartographie des mesures d’évitement et de réduction associées aux zones humides.......................................................................................................................59 Annexe 20 – Trame de restitution des fiches synthétiques de suivi pour les mesures ERCAS.....................................................................................................................................69 Annexe 21 - Cartographie des mesures d’évitement et de réduction associées aux milieux aquatiques et favorables au Castor d’Europe....................................................71 Annexe 22 - Cartographie des mesures d’évitement et de réduction favorables à la flore.........................................................................................................................................78 Annexe 23 - Cartographie des mesures d’évitement et de réduction associées à la phase de préparation du chantier.....................................................................................85 Annexe 24 - Cartographie des ouvrages de franchissements et des mesures grands carnivores...............................................................................................................................92 Annexe 25 - Schéma d’aménagements des ouvrages PTF18 et PTF144.......................99 Annexe 26 - Cartographie des habitats de substitution favorables à la faune........101 Annexe 27 – Cartographie des secteurs de travaux (MR7)..........................................108 ................................................................................................................................................110 Annexe 28 - Cartographie des mesures de réduction favorables aux amphibiens et reptiles...................................................................................................................................113 Annexe 29.a - Protocole de déplacement et de sauvetage des bryophytes saprolignicoles.....................................................................................................................120 Annexe 29.b – Protocole expérimentale de colonies gamétophytiques de Buxbaumia viridis.................................................................................................................122 Annexe 30 - Protocole de réimplantation de l’Œillet superbe....................................124 2 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 114
Annexe 31 – Cartographie des habitats d’accueil pour le Carabe noduleux...........126 Annexe 32 – Cartographie des alignements d’arbres impactés et des mesures compensatoires associées.................................................................................................128 Annexe 33 – Localisation des emprises des installations ICPE...................................130 3 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 115
Annexe 1 – Plan global de localisation du projet 4 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 116
Annexe 2 – Emprises définitives et provisoires du projet 5 74_DDT_Direction départementale des territoires de Haute-Savoie - 74-2026-08-28-00004 - ARRÊTÉ n° DDT-2026-1079 portant autorisation environnementale au titre des articles L. 181-1 et suivants du code de l'environnement relative au projet de liaison 117
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